106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1717 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1717  globin  100 
 
 		 140 aa  292  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0607  globin  33.33 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.0441362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2821  putative nitric oxide dioxygenase (NOD)  29.77 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0631  globin  30.95 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6945  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.11 
 
 		 367 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2501  globin  30 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3478  putative hemoglobin  29.93 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.540867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3532  globin  31.3 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0187  globin  31.3 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1756  globin  29.85 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407573  normal  0.0115356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1757  globin  30.65 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200751  normal  0.0117544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0207  globin  29.01 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0633  globin  30.53 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1690  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  29.69 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.369329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3847  putative globin-like protein  29.77 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4230  globin  27.27 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1891  putative flavohemoglobin  29.03 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106572  normal  0.152272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.48 
 
 		 371 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38540  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.71 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0151294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1666  putative flavohemoglobin  26.77 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164309  normal  0.0539041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4119  globin  26.92 
 
 		 403 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  30.08 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0806  globin  23.85 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  23.57 
 
 		 393 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4541  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.92 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  24.46 
 
 		 504 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  23.57 
 
 		 410 aa  54.3  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  24.03 
 
 		 393 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0985  globin  30.83 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  hitchhiker  0.0030454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0861  globin domain protein  30.83 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0153675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3989  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  29.84 
 
 		 371 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127301  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2227  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.03 
 
 		 379 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789146  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  23.81 
 
 		 426 aa  52  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.37 
 
 		 838 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  21.01 
 
 		 400 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 		 411 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1749  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.31 
 
 		 482 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  22.86 
 
 		 392 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  22.86 
 
 		 392 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  22.86 
 
 		 392 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4229  globin  26.61 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  25.37 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4950  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.53 
 
 		 372 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.46 
 
 		 394 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  21.9 
 
 		 393 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1937  flavohemoprotein, truncation  24.06 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  24.46 
 
 		 403 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  24.11 
 
 		 393 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  22.14 
 
 		 393 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1757  flavohemoprotein, truncation  24.06 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  21.32 
 
 		 393 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0325  flavohemoprotein, putative  23.91 
 
 		 381 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  22.63 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  22.63 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0495  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.32 
 
 		 383 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  22.63 
 
 		 402 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  22.63 
 
 		 402 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1574  flavohemoprotein, truncation  23.31 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  19.85 
 
 		 393 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6221  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 368 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1439  hypothetical protein  24.63 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.098408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3991  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25 
 
 		 388 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5203  nitric oxide dioxygenase  23.13 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.34382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  22.63 
 
 		 402 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3055  globin  25.49 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  20.59 
 
 		 393 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  18.05 
 
 		 400 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  20.71 
 
 		 392 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  21.54 
 
 		 399 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.81 
 
 		 383 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  19.26 
 
 		 398 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  21.9 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  21.9 
 
 		 402 aa  42.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  23.7 
 
 		 429 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  21.9 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  21.9 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  21.9 
 
 		 402 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  21.9 
 
 		 399 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  21.9 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  26.06 
 
 		 409 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0670  globin  22.9 
 
 		 393 aa  42.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1079  nitric oxide dioxygenase  21.53 
 
 		 408 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  21.32 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  21.9 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  24.82 
 
 		 398 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  23.19 
 
 		 416 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  23.7 
 
 		 406 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  21.9 
 
 		 402 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.01 
 
 		 412 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  24.31 
 
 		 393 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  21.32 
 
 		 402 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  20.74 
 
 		 394 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0224  globin  23.91 
 
 		 381 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0230  globin  23.91 
 
 		 381 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  30.88 
 
 		 409 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  23.74 
 
 		 393 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  26.32 
 
 		 396 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  25.6 
 
 		 401 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4652  nitric oxide dioxygenase  17.65 
 
 		 393 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0714  globin  21.43 
 
 		 399 aa  40.8  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.757687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>