More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1047 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  100 
 
 		 437 aa  842    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  57.35 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.94 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  40.97 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.22 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  39.91 
 
 		 462 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  40.61 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  41.91 
 
 		 460 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.78 
 
 		 453 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  39.33 
 
 		 450 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  39.22 
 
 		 450 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  37.89 
 
 		 465 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  42.46 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.12 
 
 		 450 aa  230  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  37.67 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  39.51 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  39.04 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  39.28 
 
 		 450 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  39.42 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  38.01 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.08 
 
 		 426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.28 
 
 		 433 aa  219  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  42.24 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.12 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.07 
 
 		 535 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.73 
 
 		 450 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  41.54 
 
 		 443 aa  213  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  40.28 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.57 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  42.24 
 
 		 454 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.44 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.72 
 
 		 425 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.4 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  40.77 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  45.21 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.49 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  41.23 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  37.92 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  34.08 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  34 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  31.83 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  31.88 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  33.49 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  36.98 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  31.74 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.95 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.55 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  33.93 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  35.86 
 
 		 443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  33.85 
 
 		 429 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.21 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  33.63 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  40.36 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  33.41 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  33.63 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  31.93 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.41 
 
 		 429 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  31.22 
 
 		 429 aa  170  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  31 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  32.03 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.44 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  30.77 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  33.03 
 
 		 428 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  32.08 
 
 		 426 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  32.34 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.25 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  32.52 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  32.08 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  32.59 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  32.59 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  32.59 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  32.59 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  32.59 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  36.04 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  32.59 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  32.52 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  34.19 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  37.41 
 
 		 433 aa  163  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  31.6 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  32.08 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  32.08 
 
 		 429 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  32.95 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  35.54 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  31.84 
 
 		 446 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  31.79 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0197  sun protein  35.43 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  32.05 
 
 		 427 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  31.92 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  35.95 
 
 		 421 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.57 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  31.74 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  30.72 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  31.99 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.17 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  30.4 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  31.83 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  31.83 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  32.43 
 
 		 434 aa  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  31.75 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  29.52 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>