More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0627 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 438 aa  840    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  60.58 
 
 		 415 aa  353  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  47.7 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  48.39 
 
 		 450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  50.82 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  47.92 
 
 		 450 aa  322  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  47.92 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  46.87 
 
 		 450 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  47 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  45.98 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  47.73 
 
 		 471 aa  293  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.35 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  46.3 
 
 		 440 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  43.07 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  42.82 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.92 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.35 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  45.89 
 
 		 460 aa  269  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  46.63 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.3 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  46.52 
 
 		 448 aa  266  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.03 
 
 		 410 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.14 
 
 		 422 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  41.2 
 
 		 456 aa  258  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.51 
 
 		 470 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  41.78 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  42.25 
 
 		 410 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  48.58 
 
 		 424 aa  252  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  44.11 
 
 		 463 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  40.65 
 
 		 460 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  47.02 
 
 		 454 aa  236  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.91 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.77 
 
 		 447 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.54 
 
 		 425 aa  233  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  47.24 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  49.86 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  44.29 
 
 		 421 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  42.82 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  41.13 
 
 		 493 aa  223  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.28 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.84 
 
 		 452 aa  209  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  43.46 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  35.4 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  36.59 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.2 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  34.56 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  36.83 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.99 
 
 		 462 aa  186  9e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  33.48 
 
 		 443 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  35.38 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  32.29 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  32.02 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  31.43 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  31.54 
 
 		 462 aa  179  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  33.18 
 
 		 439 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.04 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3139  sun protein  36.59 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  36.91 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3123  sun protein  36.27 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.615938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  32.74 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  37.38 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  32.11 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2509  sun protein  36.27 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  32.59 
 
 		 429 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  31.89 
 
 		 426 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  32.81 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  33.04 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  33.51 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  30.2 
 
 		 436 aa  176  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  32.37 
 
 		 429 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.13 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  31.94 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0132  sun protein  36.58 
 
 		 571 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  32.37 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0146  sun protein  35.41 
 
 		 469 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  32.84 
 
 		 427 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.42 
 
 		 455 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.94 
 
 		 446 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0165  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.41 
 
 		 469 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2801  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.41 
 
 		 469 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2279  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.41 
 
 		 469 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  30.95 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  31.26 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0155  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.41 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  35.45 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  30.9 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3061  sun protein  36.47 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0350  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.41 
 
 		 519 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  31.83 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  32.59 
 
 		 427 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  33.85 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  33.33 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  33.33 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  31.48 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  36.18 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>