More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6147 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  90.49 
 
 		 410 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  100 
 
 		 421 aa  809    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  78.72 
 
 		 422 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  55.93 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.59 
 
 		 535 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  50.49 
 
 		 410 aa  345  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  54.08 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  42.25 
 
 		 471 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.19 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  44.29 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  39.27 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.22 
 
 		 450 aa  219  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  38.75 
 
 		 450 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  39.04 
 
 		 450 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  38.44 
 
 		 450 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  38.13 
 
 		 450 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  39.95 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.82 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.04 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.01 
 
 		 450 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.18 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  36.05 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.91 
 
 		 447 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  39.45 
 
 		 440 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  35.8 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  38.93 
 
 		 448 aa  193  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  37.83 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.66 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  37 
 
 		 463 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.12 
 
 		 422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.82 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  42.25 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  41.39 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.87 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  40.67 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  39.9 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.32 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  36.29 
 
 		 460 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  36 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  35.25 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  35.95 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2083  sun protein  33.41 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  32.41 
 
 		 426 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  31.31 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  31.73 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  31.73 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  31.73 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  31.75 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  31.49 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  35.79 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  31.21 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  32.51 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  32.51 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  31.39 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  31.01 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  31.12 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  31.01 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  31.01 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  31.01 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  31.01 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  31.01 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  31.01 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  31.01 
 
 		 429 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  30.7 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  31.89 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  29.8 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  30.7 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  30.47 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  30.75 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  29.8 
 
 		 427 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  30.25 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  30.13 
 
 		 453 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  34.34 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  27.34 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  27.34 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  30.56 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  28.82 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  33.13 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  30.7 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  34.1 
 
 		 443 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  32.52 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  31.88 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2077  sun protein  32.53 
 
 		 438 aa  145  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  30.45 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  28.96 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  27.96 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  28.8 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  30.32 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.03 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  29.95 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  31.63 
 
 		 447 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  29.14 
 
 		 453 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  28.7 
 
 		 428 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  28.8 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  28.8 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  34.31 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.45 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3674  sun protein  33.64 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  30.6 
 
 		 448 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  28.75 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>