More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4779 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
426 aa  836    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  48.05 
 
 
450 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  47.61 
 
 
450 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  46.47 
 
 
450 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  46.58 
 
 
450 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  46.68 
 
 
450 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  46.21 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  46.35 
 
 
450 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  47.49 
 
 
440 aa  318  9e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  47.81 
 
 
471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  44.55 
 
 
448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  44.7 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  46.7 
 
 
438 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.45 
 
 
447 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.12 
 
 
422 aa  290  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  42.26 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  49.2 
 
 
448 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.08 
 
 
422 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  43.06 
 
 
460 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  41.65 
 
 
462 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.58 
 
 
410 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  39.78 
 
 
465 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.56 
 
 
459 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  39.78 
 
 
465 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.64 
 
 
433 aa  276  5e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  49.34 
 
 
454 aa  276  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.18 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.82 
 
 
425 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.11 
 
 
456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  44.9 
 
 
443 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  43.59 
 
 
424 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.17 
 
 
470 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  43.4 
 
 
419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  47.07 
 
 
438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  47.66 
 
 
438 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  39.58 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.65 
 
 
535 aa  250  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  39.33 
 
 
493 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.62 
 
 
415 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.31 
 
 
443 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  41.36 
 
 
437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  40.32 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.33 
 
 
436 aa  212  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  35.19 
 
 
439 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  35.22 
 
 
451 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.08 
 
 
427 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  35.65 
 
 
451 aa  207  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  35.44 
 
 
427 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  36.98 
 
 
434 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  35.14 
 
 
435 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  36.01 
 
 
437 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  35.29 
 
 
429 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  35.29 
 
 
429 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  36.32 
 
 
426 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  38.18 
 
 
429 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  36.47 
 
 
429 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  37.93 
 
 
429 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  35.12 
 
 
427 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  33.9 
 
 
440 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  37.93 
 
 
429 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  33.64 
 
 
431 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  37.93 
 
 
429 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  35.31 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  37.44 
 
 
429 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  35.92 
 
 
429 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  37.44 
 
 
429 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  34.49 
 
 
427 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  36.95 
 
 
429 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  37.44 
 
 
429 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  37.44 
 
 
429 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  37.44 
 
 
429 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  37.44 
 
 
429 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  37.44 
 
 
429 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  35.48 
 
 
427 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.96 
 
 
436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  37.44 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  33.26 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  36.84 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.11 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  37.28 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  32.92 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  35.06 
 
 
429 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  35.06 
 
 
429 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  34.9 
 
 
429 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  33.08 
 
 
452 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  32.92 
 
 
428 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  32.41 
 
 
446 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.81 
 
 
444 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  34 
 
 
428 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  32.92 
 
 
428 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  33.83 
 
 
425 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  32.92 
 
 
429 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.43 
 
 
462 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  35.47 
 
 
428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  29.56 
 
 
451 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  32.43 
 
 
428 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.24 
 
 
418 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  29.93 
 
 
451 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  34.15 
 
 
428 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  36.55 
 
 
429 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>