More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2654 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 415 aa  781    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  60.58 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  49.77 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  50.23 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  48.74 
 
 		 450 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  49.42 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  51.33 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  49.42 
 
 		 450 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  49.42 
 
 		 450 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  48.6 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  51.06 
 
 		 440 aa  312  7.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  52.04 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  48.08 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  51.92 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.94 
 
 		 535 aa  290  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  45.52 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  45.27 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  42.56 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  45.5 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  42.56 
 
 		 465 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.39 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.4 
 
 		 410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.09 
 
 		 453 aa  283  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.26 
 
 		 470 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.8 
 
 		 422 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.27 
 
 		 433 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  48.19 
 
 		 419 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.64 
 
 		 422 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  46.03 
 
 		 463 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  46.52 
 
 		 424 aa  260  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  44.32 
 
 		 448 aa  255  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  40.09 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.18 
 
 		 447 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  41.55 
 
 		 493 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.84 
 
 		 459 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  49.35 
 
 		 454 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.48 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  49.88 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  49.87 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  44.55 
 
 		 437 aa  229  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  45.65 
 
 		 421 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.23 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  35.98 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  34.4 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.22 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  37.1 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  36.97 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  38.39 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  36.3 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  34.93 
 
 		 429 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  39.64 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  35.24 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  36.14 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0017  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.1 
 
 		 448 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  35.98 
 
 		 427 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  34.84 
 
 		 427 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.29 
 
 		 452 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  34.71 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0082  sun protein  38.89 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531544  hitchhiker  0.0000000000001805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  39.82 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  36.01 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  36.45 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  36.01 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  35.48 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  36.01 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  38.66 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  39.29 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.18 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  36.21 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  36.21 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3139  sun protein  40.05 
 
 		 463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  35.13 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  38.43 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  40.88 
 
 		 433 aa  182  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  35.15 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  34.89 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  38.99 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  35.31 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  35.31 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  35.31 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  35.31 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  35.31 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  35.31 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04057  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  39.56 
 
 		 437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  35.9 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  35.31 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  35.31 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2509  sun protein  39.31 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.79792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3123  sun protein  39.31 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.615938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  32.09 
 
 		 440 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  34.4 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  33.75 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  35.06 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0015  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.48 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0208773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  39.78 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  35.14 
 
 		 433 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  33.79 
 
 		 431 aa  176  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  34.24 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  34.92 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3061  sun protein  39.53 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>