More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0522 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  88.76 
 
 
454 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  88.47 
 
 
425 aa  690    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
438 aa  840    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  66.59 
 
 
459 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  66.98 
 
 
447 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  64.14 
 
 
448 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  54.23 
 
 
463 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  54.21 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  50.11 
 
 
450 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  52.86 
 
 
471 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  49.66 
 
 
450 aa  363  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  48.65 
 
 
450 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  49.89 
 
 
450 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  50 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  49.22 
 
 
450 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  48.88 
 
 
493 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  49.21 
 
 
450 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  49.75 
 
 
460 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  47.26 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  47.72 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  45.6 
 
 
465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  45.37 
 
 
465 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.17 
 
 
453 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.37 
 
 
470 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  50.34 
 
 
440 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  41.02 
 
 
456 aa  301  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.66 
 
 
426 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  46.91 
 
 
443 aa  279  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  47.28 
 
 
438 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.69 
 
 
433 aa  266  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.04 
 
 
535 aa  254  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  42.53 
 
 
410 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.59 
 
 
422 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  43.12 
 
 
419 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  50.69 
 
 
438 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.46 
 
 
410 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.18 
 
 
422 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  42.11 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.25 
 
 
452 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  41.23 
 
 
437 aa  212  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.87 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  35.45 
 
 
426 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  35.05 
 
 
428 aa  193  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  34.63 
 
 
425 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  33.11 
 
 
440 aa  190  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  35.88 
 
 
429 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  35.88 
 
 
429 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.86 
 
 
451 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  35.36 
 
 
429 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  35.28 
 
 
429 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  35.38 
 
 
427 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  33.67 
 
 
426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  35.09 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  42.09 
 
 
421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  36.3 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  35.45 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  34.36 
 
 
428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  34.83 
 
 
428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  33.93 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  31.45 
 
 
451 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  34.79 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  35.79 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  36.32 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  31.65 
 
 
443 aa  180  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  31 
 
 
451 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3351  sun protein  38.26 
 
 
443 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  32.1 
 
 
447 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  31.74 
 
 
462 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  33.25 
 
 
452 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  34.03 
 
 
427 aa  177  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  38.02 
 
 
428 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  32.54 
 
 
436 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.19 
 
 
436 aa  176  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  35.56 
 
 
439 aa  176  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  34.42 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3243  sun protein  39.84 
 
 
457 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0039  sun protein  36.57 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  32.47 
 
 
432 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.42 
 
 
427 aa  173  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3894  sun protein  38.4 
 
 
457 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3674  sun protein  37.73 
 
 
443 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  35.62 
 
 
464 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3405  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.14 
 
 
457 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.89 
 
 
443 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  36.34 
 
 
448 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  33.76 
 
 
429 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.69 
 
 
449 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  32.18 
 
 
445 aa  170  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  37.73 
 
 
431 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3562  sun protein  36.39 
 
 
457 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0313  sun protein  35.9 
 
 
457 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4436  sun protein  35.17 
 
 
445 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4412  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.71 
 
 
457 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.658908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.26 
 
 
429 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.19 
 
 
462 aa  169  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.52 
 
 
452 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0075  putative RNA methyltransferase (SUN protein)  38.4 
 
 
441 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191133  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  32.81 
 
 
429 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  33.02 
 
 
429 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  34.58 
 
 
446 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>