More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2140 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  979    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  41.35 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  39.11 
 
 		 490 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  38.33 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.05 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  38.48 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  37.89 
 
 		 498 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  36.17 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  36.12 
 
 		 494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  34.62 
 
 		 535 aa  306  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  33.85 
 
 		 532 aa  302  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  35.6 
 
 		 497 aa  300  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  34.73 
 
 		 501 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  33.82 
 
 		 496 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  33.82 
 
 		 496 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  35.36 
 
 		 492 aa  286  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  34.85 
 
 		 494 aa  286  8e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  33.4 
 
 		 549 aa  286  8e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  34.92 
 
 		 504 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  32.96 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  34.38 
 
 		 490 aa  280  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  32.84 
 
 		 491 aa  279  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  35.38 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  36.34 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  34.58 
 
 		 544 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  33.33 
 
 		 499 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  33.48 
 
 		 497 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.5 
 
 		 497 aa  272  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  33.7 
 
 		 497 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  33.48 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  33.48 
 
 		 497 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  33.77 
 
 		 494 aa  269  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  34.06 
 
 		 496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  34.14 
 
 		 496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  33.41 
 
 		 498 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  31.29 
 
 		 534 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  31.28 
 
 		 556 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  32.96 
 
 		 498 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  32.92 
 
 		 495 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  55.7 
 
 		 270 aa  256  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  55.7 
 
 		 270 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  55.7 
 
 		 270 aa  256  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  55.74 
 
 		 270 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  55.27 
 
 		 254 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  57.21 
 
 		 270 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  55.32 
 
 		 270 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  55.27 
 
 		 254 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  54.47 
 
 		 267 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  34.73 
 
 		 521 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  54.47 
 
 		 267 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  56.94 
 
 		 270 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  48.57 
 
 		 609 aa  246  4e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  30.22 
 
 		 556 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  50.93 
 
 		 578 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  30.12 
 
 		 551 aa  239  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  51.61 
 
 		 288 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  31.17 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  47.88 
 
 		 308 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  42.42 
 
 		 258 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  45.66 
 
 		 261 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  48.21 
 
 		 264 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  51.34 
 
 		 259 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  43.4 
 
 		 279 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  46.58 
 
 		 263 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  40.72 
 
 		 262 aa  183  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  39.71 
 
 		 293 aa  177  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  38.29 
 
 		 276 aa  177  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  40.57 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  39.91 
 
 		 269 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  38.77 
 
 		 269 aa  173  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  37.17 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  39.06 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  37.39 
 
 		 365 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  38.39 
 
 		 258 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  39.07 
 
 		 375 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  43.32 
 
 		 282 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  37.95 
 
 		 282 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  34.96 
 
 		 318 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.74 
 
 		 299 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  36.53 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.21 
 
 		 278 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  36.32 
 
 		 320 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  39.62 
 
 		 285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  39.45 
 
 		 293 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  36.07 
 
 		 359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  38.81 
 
 		 289 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  35.02 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.72 
 
 		 280 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  36.53 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  35.87 
 
 		 324 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.45 
 
 		 308 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  34.67 
 
 		 309 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  37.33 
 
 		 305 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  37.98 
 
 		 281 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  33.19 
 
 		 271 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  37.44 
 
 		 405 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.82 
 
 		 289 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  34.53 
 
 		 292 aa  163  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  36.49 
 
 		 338 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  37.61 
 
 		 276 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>