More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3059 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  65.45 
 
 
492 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  61.66 
 
 
501 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  100 
 
 
495 aa  1014    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  61.69 
 
 
497 aa  634  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  59.92 
 
 
497 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  60.93 
 
 
497 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  60.32 
 
 
497 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  60.32 
 
 
497 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  59.8 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  58.91 
 
 
504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  59.51 
 
 
496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  59.51 
 
 
521 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  58.5 
 
 
544 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  59.15 
 
 
494 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  58.1 
 
 
498 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  56.68 
 
 
498 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  52.38 
 
 
534 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  51.71 
 
 
497 aa  521  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  50.61 
 
 
490 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  51 
 
 
493 aa  498  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  50.61 
 
 
491 aa  492  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  50.2 
 
 
496 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.93 
 
 
499 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  46.89 
 
 
495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  45.86 
 
 
494 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  44.58 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  43.34 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  42.6 
 
 
496 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  42.6 
 
 
496 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  40.33 
 
 
535 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  40.6 
 
 
532 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  39.96 
 
 
490 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  39.8 
 
 
496 aa  359  5e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  38.68 
 
 
494 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  39.33 
 
 
549 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.02 
 
 
502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  38.45 
 
 
498 aa  334  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  34.9 
 
 
549 aa  316  7e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  33.1 
 
 
578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  35.56 
 
 
492 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  36 
 
 
556 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.14 
 
 
551 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  35.26 
 
 
556 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  35.38 
 
 
474 aa  276  4e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.38 
 
 
267 aa  246  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.38 
 
 
267 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  51.29 
 
 
270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  50.42 
 
 
270 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  51.28 
 
 
270 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  50.21 
 
 
270 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  50.21 
 
 
254 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.21 
 
 
270 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.21 
 
 
270 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  50.21 
 
 
254 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  51.29 
 
 
288 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  48.51 
 
 
609 aa  237  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  53.85 
 
 
270 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  47.3 
 
 
308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  45.68 
 
 
259 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  48.39 
 
 
261 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  43.51 
 
 
258 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  47.42 
 
 
264 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  48.7 
 
 
263 aa  193  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  40.59 
 
 
310 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  41.59 
 
 
338 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  39.64 
 
 
279 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  41.28 
 
 
310 aa  173  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  43.72 
 
 
305 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  41.1 
 
 
306 aa  173  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  40.99 
 
 
256 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  40 
 
 
305 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  42.27 
 
 
324 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  39.81 
 
 
269 aa  172  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  39.27 
 
 
276 aa  171  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  42.66 
 
 
304 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  37.96 
 
 
284 aa  170  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  41.82 
 
 
324 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  40.72 
 
 
309 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  38.74 
 
 
258 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  39.35 
 
 
269 aa  168  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  39.11 
 
 
301 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  38.74 
 
 
262 aa  168  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  41.74 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  41.36 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  38.12 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  41.1 
 
 
308 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  38.29 
 
 
318 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  42.63 
 
 
337 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  37.95 
 
 
375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  38.12 
 
 
314 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  42.63 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  39.19 
 
 
367 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3368  hypothetical protein  33.78 
 
 
309 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0275046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  39.46 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  40.83 
 
 
307 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  39.29 
 
 
304 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  40.44 
 
 
316 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  39.29 
 
 
304 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  35.17 
 
 
307 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  41.88 
 
 
318 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>