More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1051 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  1019    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  54.55 
 
 
496 aa  547  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  52.98 
 
 
490 aa  523  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.89 
 
 
502 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  43.44 
 
 
497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  43.89 
 
 
498 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  42.97 
 
 
486 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  41.49 
 
 
532 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  41.56 
 
 
494 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  40.39 
 
 
535 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  39.22 
 
 
496 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  39.22 
 
 
496 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  42.18 
 
 
492 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  40.41 
 
 
549 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.92 
 
 
501 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  39.52 
 
 
497 aa  364  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  38.68 
 
 
497 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  38.68 
 
 
495 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  39.21 
 
 
497 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  39.13 
 
 
497 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  38.64 
 
 
497 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  38.25 
 
 
544 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.96 
 
 
534 aa  343  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  39.14 
 
 
493 aa  342  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  37.1 
 
 
490 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  38.17 
 
 
496 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  39 
 
 
496 aa  339  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  38.14 
 
 
491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  37.14 
 
 
494 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.16 
 
 
504 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.81 
 
 
497 aa  330  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  37.01 
 
 
498 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  42.76 
 
 
521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  36.51 
 
 
498 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.84 
 
 
499 aa  320  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  36.12 
 
 
474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  36.48 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  37.07 
 
 
495 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  33.64 
 
 
549 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  36.64 
 
 
496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  52.8 
 
 
578 aa  242  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  52.02 
 
 
288 aa  236  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.53 
 
 
267 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.29 
 
 
267 aa  232  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  52.45 
 
 
609 aa  232  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50 
 
 
270 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50 
 
 
270 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  54.63 
 
 
270 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  49.56 
 
 
270 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  50.93 
 
 
270 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  30.39 
 
 
556 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  29.67 
 
 
556 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  46.09 
 
 
258 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  30.42 
 
 
551 aa  209  8e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  54.26 
 
 
259 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  53.44 
 
 
264 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  50.5 
 
 
308 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  46.3 
 
 
261 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  42.86 
 
 
279 aa  190  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  46.34 
 
 
263 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  43.69 
 
 
405 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  43.4 
 
 
289 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  42.93 
 
 
375 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  42.2 
 
 
304 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  39.55 
 
 
263 aa  173  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  36.5 
 
 
329 aa  173  6.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  40.62 
 
 
304 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  41.23 
 
 
269 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  42.33 
 
 
310 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  43.2 
 
 
365 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  43.41 
 
 
294 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  43.41 
 
 
294 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  41.55 
 
 
316 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  38.76 
 
 
284 aa  170  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  39.53 
 
 
293 aa  170  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  41.26 
 
 
301 aa  170  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  41.55 
 
 
308 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  39.53 
 
 
269 aa  169  7e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  42.23 
 
 
391 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  42.72 
 
 
364 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  41.55 
 
 
308 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  41.95 
 
 
367 aa  169  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 
308 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 
308 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  40 
 
 
270 aa  169  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  40.78 
 
 
324 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  41.1 
 
 
316 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  41.1 
 
 
310 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  41.95 
 
 
383 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  39.09 
 
 
271 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  39.29 
 
 
314 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  41.1 
 
 
314 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  42.72 
 
 
513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  41.31 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  41.55 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  41.55 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>