More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1576 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  100 
 
 
492 aa  994    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  38.16 
 
 
486 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  34.96 
 
 
497 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  36.07 
 
 
497 aa  328  9e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  36.46 
 
 
493 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  38.48 
 
 
474 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  36.68 
 
 
490 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.69 
 
 
501 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  33.71 
 
 
549 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.47 
 
 
502 aa  317  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  33.55 
 
 
504 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  33.83 
 
 
494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  36.59 
 
 
496 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  34.42 
 
 
497 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  36.14 
 
 
544 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  35.95 
 
 
492 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  33.94 
 
 
532 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  33.13 
 
 
535 aa  310  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  33.2 
 
 
496 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  33.2 
 
 
496 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  36.48 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  33.11 
 
 
496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  34.35 
 
 
497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  34.06 
 
 
497 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  34.57 
 
 
497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.57 
 
 
497 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  35.89 
 
 
495 aa  299  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  34.54 
 
 
499 aa  299  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  34.21 
 
 
495 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  35.09 
 
 
498 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  33.4 
 
 
496 aa  295  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  34.9 
 
 
498 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  33.48 
 
 
494 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  35.55 
 
 
490 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  33.56 
 
 
491 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  32.16 
 
 
534 aa  289  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  35.06 
 
 
498 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  33.63 
 
 
521 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  31.41 
 
 
549 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  32.59 
 
 
496 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  30.88 
 
 
551 aa  244  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  31.03 
 
 
556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  31.27 
 
 
556 aa  236  7e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  46.72 
 
 
609 aa  230  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  47.79 
 
 
288 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.67 
 
 
270 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.67 
 
 
270 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  50.67 
 
 
270 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  44.87 
 
 
578 aa  220  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  50.67 
 
 
270 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  50.22 
 
 
254 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  50.22 
 
 
254 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  51.77 
 
 
270 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  50.22 
 
 
270 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  50.22 
 
 
270 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.55 
 
 
267 aa  213  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.66 
 
 
267 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  43.15 
 
 
259 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  43.17 
 
 
308 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  46.7 
 
 
264 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  43.94 
 
 
258 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  42.18 
 
 
261 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  44.39 
 
 
263 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  39.56 
 
 
279 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  37.09 
 
 
282 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  36.89 
 
 
296 aa  158  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  35.71 
 
 
337 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  34.2 
 
 
359 aa  157  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  35.32 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  38.07 
 
 
290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  35.32 
 
 
324 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  35.4 
 
 
293 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  38.86 
 
 
288 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35 
 
 
289 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  35.98 
 
 
304 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  36.79 
 
 
284 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  34.22 
 
 
305 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  35.71 
 
 
305 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  39.89 
 
 
291 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  33.02 
 
 
357 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  35.79 
 
 
310 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  34.67 
 
 
304 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  37.9 
 
 
262 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  33.02 
 
 
298 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  35.62 
 
 
310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0369  hypothetical protein  36.45 
 
 
253 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  34.91 
 
 
288 aa  147  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  36.54 
 
 
268 aa  146  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  33.64 
 
 
280 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  34.01 
 
 
285 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  38.02 
 
 
288 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  33.64 
 
 
280 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  34.25 
 
 
265 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  38.02 
 
 
288 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  32 
 
 
274 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  34.7 
 
 
316 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  33.18 
 
 
329 aa  145  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  32.74 
 
 
304 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  37.43 
 
 
302 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  36.22 
 
 
308 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>