More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01607 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  45.68 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  47.86 
 
 		 497 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  46.61 
 
 		 496 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  46.61 
 
 		 496 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  44.14 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  49.11 
 
 		 549 aa  221  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  48.09 
 
 		 535 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  47.95 
 
 		 532 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  46.46 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  46.02 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  46.02 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  44.35 
 
 		 494 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  46.02 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  46.02 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  46.02 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  46.02 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  45.58 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  45.58 
 
 		 270 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  46.02 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  45.02 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  44.26 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  47.25 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  43.04 
 
 		 486 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.37 
 
 		 502 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  41.13 
 
 		 490 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  50.51 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  43.4 
 
 		 474 aa  202  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  42.11 
 
 		 497 aa  202  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  45.02 
 
 		 496 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  40.93 
 
 		 491 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  47.03 
 
 		 498 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.8 
 
 		 504 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  42.42 
 
 		 544 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  42.98 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.97 
 
 		 534 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  45.41 
 
 		 498 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  42.42 
 
 		 496 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  45.41 
 
 		 497 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  44.93 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  44.5 
 
 		 497 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  44.5 
 
 		 497 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.17 
 
 		 501 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  44.29 
 
 		 490 aa  192  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  43.89 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  42.86 
 
 		 494 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  49.2 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  43.58 
 
 		 497 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  43.72 
 
 		 496 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  40.43 
 
 		 494 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  39.04 
 
 		 493 aa  185  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  41.77 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  40.17 
 
 		 549 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  41.47 
 
 		 609 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  41.7 
 
 		 496 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.08 
 
 		 499 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  39.64 
 
 		 495 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  40.09 
 
 		 578 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.16 
 
 		 497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  36.08 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  38.24 
 
 		 556 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  39.56 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  36.03 
 
 		 556 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  40.67 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.82 
 
 		 551 aa  169  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  33.71 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  38.14 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  38.83 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.92 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  36.28 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  36.28 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  36.7 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.21 
 
 		 299 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  37.66 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  36.61 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  36.65 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  36.65 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  37.44 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.68 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  38.1 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  36.2 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  35.56 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  37.29 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  36.4 
 
 		 288 aa  158  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  37.29 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  36.92 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  35.54 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  38.18 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  38.53 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  35.97 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  34.45 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  33.19 
 
 		 447 aa  156  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  34.45 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  34.87 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  34.91 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  38.12 
 
 		 348 aa  155  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  34.2 
 
 		 338 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  38.12 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  36.02 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  34.2 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>