More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34890 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  75.25 
 
 
338 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  73.38 
 
 
307 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  72.9 
 
 
310 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  71.66 
 
 
324 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  75.34 
 
 
308 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  71.8 
 
 
324 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  74.66 
 
 
308 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  74.41 
 
 
300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  73.36 
 
 
304 aa  447  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  73.97 
 
 
308 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  71.76 
 
 
304 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  70.89 
 
 
301 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  73.49 
 
 
513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  73.54 
 
 
322 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  74.83 
 
 
316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  73.03 
 
 
304 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  74.83 
 
 
316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  74.83 
 
 
316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  71.94 
 
 
316 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  73.15 
 
 
308 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  73.49 
 
 
308 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  73.49 
 
 
308 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  73.49 
 
 
308 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  71.75 
 
 
314 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  69.84 
 
 
304 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  72.48 
 
 
310 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  71.24 
 
 
304 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  71.61 
 
 
316 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  72.73 
 
 
309 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  82.03 
 
 
305 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  74.75 
 
 
300 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  77.52 
 
 
310 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  72.48 
 
 
305 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  74.37 
 
 
316 aa  427  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  68.2 
 
 
306 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  68.12 
 
 
359 aa  425  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  70.49 
 
 
307 aa  424  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  70.67 
 
 
305 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  68.23 
 
 
337 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  76.95 
 
 
304 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  73.13 
 
 
316 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  76.95 
 
 
304 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  68.94 
 
 
302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  66.21 
 
 
305 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  66.89 
 
 
306 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  68.36 
 
 
258 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  61.98 
 
 
288 aa  358  5e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  67.76 
 
 
256 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  67.21 
 
 
258 aa  349  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  63.67 
 
 
320 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  53.02 
 
 
309 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  56.11 
 
 
318 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  60.48 
 
 
305 aa  322  7e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  54.83 
 
 
292 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  59.38 
 
 
269 aa  316  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  59.77 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  57.25 
 
 
295 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  56.44 
 
 
276 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  55.38 
 
 
281 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  57.83 
 
 
285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  53.7 
 
 
271 aa  298  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  60.26 
 
 
327 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  57.37 
 
 
310 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  55.08 
 
 
274 aa  291  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  61.71 
 
 
367 aa  288  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  51.29 
 
 
280 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  58.8 
 
 
297 aa  286  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  60.43 
 
 
340 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  59.5 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1564  hypothetical protein  49.82 
 
 
279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  59.29 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  54.23 
 
 
283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  59.32 
 
 
336 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  53.52 
 
 
277 aa  285  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  59.64 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  56.07 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  53.82 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  53.82 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  61.16 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  58.93 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  53.94 
 
 
274 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  59.57 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  52.38 
 
 
285 aa  281  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  50.18 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  56.78 
 
 
271 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  56.78 
 
 
271 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  58.12 
 
 
324 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  52.5 
 
 
391 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  55.93 
 
 
272 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  58.97 
 
 
318 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  54.11 
 
 
281 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  52.17 
 
 
273 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4193  hypothetical protein  52.36 
 
 
278 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  56.84 
 
 
301 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  57.21 
 
 
369 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  55.56 
 
 
364 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  58.82 
 
 
375 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  59.36 
 
 
276 aa  276  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1170  protein of unknown function DUF344  52.23 
 
 
278 aa  276  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0866985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>