More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0715 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  100 
 
 
551 aa  1140    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  90.99 
 
 
556 aa  1048    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  56.89 
 
 
556 aa  615  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  38.64 
 
 
544 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  37.31 
 
 
497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  38.25 
 
 
496 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  37.26 
 
 
497 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  37.12 
 
 
497 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  36.54 
 
 
497 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  36.38 
 
 
496 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  37.62 
 
 
498 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  37.07 
 
 
498 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.01 
 
 
504 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  35.77 
 
 
491 aa  299  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.08 
 
 
501 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  36.61 
 
 
494 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  34.17 
 
 
492 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  35.38 
 
 
495 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  34.04 
 
 
497 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  36.47 
 
 
521 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  32.95 
 
 
497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  34.67 
 
 
495 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  32.7 
 
 
499 aa  273  9e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  33.14 
 
 
497 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  32.94 
 
 
493 aa  263  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  34.22 
 
 
494 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  33.83 
 
 
496 aa  260  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  33.2 
 
 
496 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  33.2 
 
 
496 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  33.6 
 
 
490 aa  252  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  30.36 
 
 
486 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  30.88 
 
 
492 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  31.88 
 
 
534 aa  240  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  30.12 
 
 
474 aa  239  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  30.27 
 
 
490 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  29.67 
 
 
496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  29.4 
 
 
549 aa  229  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  29.72 
 
 
549 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  30.38 
 
 
532 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  29.84 
 
 
502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  30.27 
 
 
535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  49.78 
 
 
270 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.78 
 
 
270 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.73 
 
 
270 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  49.56 
 
 
270 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  49.78 
 
 
270 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  49.78 
 
 
254 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  49.78 
 
 
254 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  49.12 
 
 
288 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  51.39 
 
 
270 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.46 
 
 
267 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.46 
 
 
267 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  47.71 
 
 
609 aa  212  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  47.18 
 
 
308 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  30.42 
 
 
494 aa  209  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  49.51 
 
 
264 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  47.35 
 
 
259 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  28.8 
 
 
498 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  46.09 
 
 
261 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  51.06 
 
 
270 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  45.19 
 
 
258 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  43.15 
 
 
578 aa  204  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  45.61 
 
 
263 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  37.82 
 
 
279 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  38.5 
 
 
292 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  37.44 
 
 
256 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  36.77 
 
 
263 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  38.01 
 
 
365 aa  157  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  35.98 
 
 
302 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  39.2 
 
 
258 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  36.24 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  37.17 
 
 
288 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  36.84 
 
 
310 aa  154  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  35.4 
 
 
318 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  41.03 
 
 
304 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  36.24 
 
 
337 aa  153  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  37.78 
 
 
324 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  37.65 
 
 
304 aa  153  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  39.09 
 
 
367 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  41.03 
 
 
304 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  39.39 
 
 
405 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  35.5 
 
 
280 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  39.9 
 
 
393 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  38.12 
 
 
308 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  37.61 
 
 
297 aa  151  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  40.84 
 
 
383 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  33.48 
 
 
320 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  36.75 
 
 
307 aa  150  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  37.28 
 
 
326 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  36 
 
 
305 aa  150  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  38.01 
 
 
340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  38.89 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  37.71 
 
 
306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  36.96 
 
 
310 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  39.39 
 
 
357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  39.39 
 
 
298 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  36.24 
 
 
305 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  35.59 
 
 
280 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  37.88 
 
 
300 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  35.59 
 
 
280 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>