More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2533 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  100 
 
 
491 aa  997    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  51.72 
 
 
492 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  51.32 
 
 
497 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.89 
 
 
501 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  50 
 
 
495 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  48.22 
 
 
493 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  49.29 
 
 
496 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  48.38 
 
 
497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  48.03 
 
 
490 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  48.37 
 
 
497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  47.97 
 
 
497 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  47.98 
 
 
497 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  47.27 
 
 
497 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  48.79 
 
 
496 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  47.47 
 
 
495 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  48.58 
 
 
544 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.15 
 
 
504 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.13 
 
 
534 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  49.39 
 
 
521 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  47.76 
 
 
494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  47.36 
 
 
498 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  47.56 
 
 
498 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.11 
 
 
499 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  41.56 
 
 
532 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  42.57 
 
 
494 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  40.41 
 
 
535 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  40.37 
 
 
497 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  39.96 
 
 
496 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  39.96 
 
 
496 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  41.37 
 
 
486 aa  382  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  43.06 
 
 
496 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  38.09 
 
 
490 aa  366  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  39.05 
 
 
549 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.8 
 
 
502 aa  361  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  39.92 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  38.14 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  38.43 
 
 
498 aa  332  8e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  32.6 
 
 
549 aa  303  6.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.77 
 
 
551 aa  299  7e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  35.86 
 
 
556 aa  295  9e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  33.56 
 
 
492 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  32.84 
 
 
474 aa  279  7e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  35.11 
 
 
556 aa  276  9e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  52.12 
 
 
288 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.56 
 
 
267 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.14 
 
 
267 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  51.71 
 
 
578 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  51.07 
 
 
270 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  50.21 
 
 
270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  51.28 
 
 
270 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.21 
 
 
270 aa  242  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  51.25 
 
 
609 aa  242  9e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  50.21 
 
 
254 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.21 
 
 
270 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  50.21 
 
 
254 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  50.21 
 
 
270 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  50.39 
 
 
308 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  48.12 
 
 
258 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  49.79 
 
 
259 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  50.72 
 
 
270 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  52 
 
 
264 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  51.43 
 
 
263 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  49.32 
 
 
261 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  40.93 
 
 
279 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  37.29 
 
 
338 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  38.91 
 
 
263 aa  177  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  40.45 
 
 
292 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  40.09 
 
 
288 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  40.81 
 
 
304 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  38.84 
 
 
276 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  40.27 
 
 
314 aa  173  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  36.23 
 
 
307 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4120  protein of unknown function DUF344  38.71 
 
 
277 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.794478  hitchhiker  0.00182923 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  39.82 
 
 
324 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0369  hypothetical protein  43.06 
 
 
253 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  39.55 
 
 
318 aa  172  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  39.82 
 
 
340 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  40.36 
 
 
405 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  38.91 
 
 
297 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  39.46 
 
 
256 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  40 
 
 
281 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  38.91 
 
 
324 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  39.91 
 
 
304 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  39.82 
 
 
265 aa  168  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  38.91 
 
 
285 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  37.05 
 
 
301 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  38.01 
 
 
303 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  39.09 
 
 
309 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  38.66 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  38.16 
 
 
274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  36.65 
 
 
262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  39.57 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  39.57 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  39.55 
 
 
359 aa  167  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  39.55 
 
 
337 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  38.57 
 
 
365 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  39.09 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  38.29 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  39.82 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  39.91 
 
 
306 aa  167  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>