More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0972 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  100 
 
 
265 aa  554  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  65.02 
 
 
287 aa  367  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  67.06 
 
 
261 aa  359  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  67.06 
 
 
261 aa  359  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6193  hypothetical protein  69.51 
 
 
265 aa  358  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1514  hypothetical protein  64.89 
 
 
281 aa  357  9e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.744458 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  66.27 
 
 
286 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  66.27 
 
 
286 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1410  hypothetical protein  62.5 
 
 
268 aa  352  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0994323  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6004  hypothetical protein  62.02 
 
 
280 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47701  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1864  hypothetical protein  64.15 
 
 
263 aa  345  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844813  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4488  hypothetical protein  65.69 
 
 
286 aa  342  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.521418  normal  0.0804877 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0130  hypothetical protein  65.04 
 
 
263 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.898159 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4523  hypothetical protein  62.6 
 
 
284 aa  333  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.872957  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  61.44 
 
 
257 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4849  hypothetical protein  68.63 
 
 
272 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0355335 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1667  hypothetical protein  63.01 
 
 
251 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.157916  normal  0.465786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  52.38 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  53.39 
 
 
340 aa  282  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  50.81 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  53.85 
 
 
393 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  53.72 
 
 
338 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  53.81 
 
 
314 aa  280  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  53.72 
 
 
336 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  53.72 
 
 
340 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  53.04 
 
 
405 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  54.01 
 
 
303 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  53.11 
 
 
310 aa  278  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  55.27 
 
 
365 aa  278  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  56.25 
 
 
269 aa  277  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  57.14 
 
 
288 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  57.78 
 
 
305 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  56.5 
 
 
269 aa  275  5e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  54.24 
 
 
298 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  49.4 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  56.96 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  53.81 
 
 
357 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  52.99 
 
 
293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  54.46 
 
 
276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  56.05 
 
 
320 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  57.21 
 
 
337 aa  271  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  53.74 
 
 
326 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  55.88 
 
 
304 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  56.76 
 
 
359 aa  270  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  53.81 
 
 
296 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  52.54 
 
 
318 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  51.48 
 
 
364 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  55.88 
 
 
304 aa  268  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  53.23 
 
 
307 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  53.82 
 
 
324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  50.96 
 
 
310 aa  268  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  56.58 
 
 
316 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  52.3 
 
 
375 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  52.73 
 
 
293 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  54.35 
 
 
280 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  48.25 
 
 
391 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  51.27 
 
 
301 aa  266  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  57.92 
 
 
310 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  51.9 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  58.18 
 
 
513 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  52.02 
 
 
316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  52.78 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  57.92 
 
 
308 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  54.89 
 
 
306 aa  265  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  53.81 
 
 
304 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  49.8 
 
 
369 aa  265  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  57.92 
 
 
308 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  57.92 
 
 
308 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  54.07 
 
 
307 aa  265  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  53.16 
 
 
296 aa  265  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  48.21 
 
 
326 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  57.47 
 
 
308 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  54.74 
 
 
338 aa  264  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0369  hypothetical protein  51.22 
 
 
253 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  52.55 
 
 
310 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  52.32 
 
 
316 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  55.02 
 
 
305 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  52.53 
 
 
316 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  52.53 
 
 
316 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  52.53 
 
 
316 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  51.75 
 
 
316 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  51.79 
 
 
314 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  50.21 
 
 
329 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  53.51 
 
 
256 aa  262  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  51.5 
 
 
284 aa  263  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  54.94 
 
 
304 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  54.94 
 
 
304 aa  262  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  53.56 
 
 
301 aa  262  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  51.25 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  49.58 
 
 
311 aa  261  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  49.59 
 
 
367 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  50.89 
 
 
383 aa  261  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04552  transcriptional regulator  55.5 
 
 
260 aa  261  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.552506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  55.41 
 
 
305 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  54.59 
 
 
300 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  56.94 
 
 
300 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  51.75 
 
 
316 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  53.28 
 
 
306 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  48.58 
 
 
324 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>