More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0123 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  70.91 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  68.31 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  68.63 
 
 		 329 aa  391  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  73.2 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  72.59 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  72.51 
 
 		 316 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  67.4 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  65.48 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  70.12 
 
 		 303 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  63.29 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  63.99 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  71.31 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  67.92 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  68.97 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  66.04 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  66.42 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  65.89 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  68.99 
 
 		 304 aa  363  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  65.5 
 
 		 298 aa  362  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  65.53 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  67.32 
 
 		 340 aa  362  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  69.47 
 
 		 372 aa  360  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  66.41 
 
 		 364 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  63.8 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  67.95 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  66.93 
 
 		 365 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  63.85 
 
 		 326 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  62.69 
 
 		 369 aa  358  5e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  64.16 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  64.37 
 
 		 331 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  64.31 
 
 		 391 aa  356  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  63.57 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  66.01 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  65.62 
 
 		 383 aa  348  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  65.35 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  65.35 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  65.35 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  67.46 
 
 		 296 aa  346  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  64.92 
 
 		 263 aa  343  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  65.89 
 
 		 310 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  66.67 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  58.72 
 
 		 256 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  62.5 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  57.25 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  61.88 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  55.51 
 
 		 306 aa  292  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  62.05 
 
 		 338 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  59.24 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  58.9 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  58.9 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  54.41 
 
 		 289 aa  289  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  58.3 
 
 		 258 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  54.09 
 
 		 281 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  60.89 
 
 		 306 aa  288  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  62.73 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  54.92 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  58.05 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  60.99 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  57.63 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  58.3 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  57.02 
 
 		 304 aa  285  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  54.02 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  61.09 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  61.09 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  61.09 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  58.9 
 
 		 307 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  61.09 
 
 		 513 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  59.82 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  51.5 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  60.35 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  59.21 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  60.63 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  63.33 
 
 		 316 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  60.36 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  59.57 
 
 		 305 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  59.73 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  55.6 
 
 		 316 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  53.17 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  56.85 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  55.19 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  55.19 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  55.65 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  52.22 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  57.38 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  57.38 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  62.86 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  58.37 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  56.56 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  58.59 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  56.36 
 
 		 293 aa  278  8e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  56.07 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  60.36 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  53.78 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  56.96 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  62.38 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  62.38 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  50 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  62.38 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  59.91 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>