More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2934 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  75.97 
 
 
327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  72.5 
 
 
324 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  75.45 
 
 
296 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  70.71 
 
 
328 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  76.26 
 
 
303 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  70 
 
 
316 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  72.93 
 
 
310 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  66.12 
 
 
311 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  69.06 
 
 
304 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  68.38 
 
 
301 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  67.63 
 
 
310 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  67.92 
 
 
314 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  73.2 
 
 
296 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  66.55 
 
 
296 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  69.26 
 
 
294 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  69.26 
 
 
294 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  69.26 
 
 
294 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  69.29 
 
 
263 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  65.56 
 
 
299 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  68.53 
 
 
340 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  67.84 
 
 
357 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  58.84 
 
 
329 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  68.13 
 
 
338 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  69.72 
 
 
340 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  67.98 
 
 
364 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  68.53 
 
 
336 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  67.84 
 
 
298 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  68.65 
 
 
405 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  65.23 
 
 
326 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  66.93 
 
 
331 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  65.75 
 
 
326 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  66.03 
 
 
393 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  66.01 
 
 
365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  67.98 
 
 
383 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  64.48 
 
 
369 aa  360  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  59.37 
 
 
375 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  62.2 
 
 
297 aa  356  3.9999999999999996e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  69.02 
 
 
372 aa  355  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  67.07 
 
 
391 aa  355  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  64.29 
 
 
314 aa  353  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  67.45 
 
 
367 aa  352  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  59.15 
 
 
256 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  60.54 
 
 
320 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  58.63 
 
 
288 aa  298  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  58.3 
 
 
281 aa  298  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  53.39 
 
 
300 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  59.15 
 
 
258 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  60.81 
 
 
258 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  55.42 
 
 
293 aa  293  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  57.79 
 
 
302 aa  291  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  59.75 
 
 
337 aa  290  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  55.14 
 
 
289 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  56.33 
 
 
305 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  52.94 
 
 
289 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  59.46 
 
 
305 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  49.46 
 
 
294 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  60.68 
 
 
316 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  53.82 
 
 
322 aa  289  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  58.87 
 
 
304 aa  288  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  59.32 
 
 
316 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  56.92 
 
 
324 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  58.9 
 
 
359 aa  287  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  49.63 
 
 
299 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  58.52 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  53.46 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  60.43 
 
 
307 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  53.69 
 
 
294 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  59.05 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  60 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3195  hypothetical protein  51.59 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0203671  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  58.19 
 
 
305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  61.33 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  58.87 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  54.48 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  58.05 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  58.05 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  59.66 
 
 
314 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  54.72 
 
 
307 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  56.96 
 
 
338 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  60.36 
 
 
308 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  60.36 
 
 
304 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  56.84 
 
 
306 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  60.63 
 
 
308 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  57.02 
 
 
280 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  60.36 
 
 
304 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  60.36 
 
 
310 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  60.18 
 
 
306 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  62.86 
 
 
513 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  58.97 
 
 
305 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  56.78 
 
 
305 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  56.47 
 
 
310 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  58.82 
 
 
316 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  53.36 
 
 
300 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  59.24 
 
 
316 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  59.24 
 
 
316 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  59.24 
 
 
316 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  58.97 
 
 
310 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  52.73 
 
 
314 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  58.97 
 
 
308 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>