More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1700 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 286 aa  594  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 286 aa  594  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  75.26 
 
 		 287 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1514  hypothetical protein  72.22 
 
 		 281 aa  418  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.744458 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4523  hypothetical protein  78.23 
 
 		 284 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.872957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4488  hypothetical protein  69.69 
 
 		 286 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.521418  normal  0.0804877 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6004  hypothetical protein  65.69 
 
 		 280 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6193  hypothetical protein  63.4 
 
 		 265 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  67.07 
 
 		 265 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1410  hypothetical protein  64.4 
 
 		 268 aa  344  8.999999999999999e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0994323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1864  hypothetical protein  63.01 
 
 		 263 aa  328  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844813  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  61.13 
 
 		 261 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  61.13 
 
 		 261 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  65.11 
 
 		 257 aa  315  7e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0130  hypothetical protein  60 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.898159 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  54.29 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  55.36 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  55.19 
 
 		 405 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  57.33 
 
 		 269 aa  278  7e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  56.36 
 
 		 357 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  54.81 
 
 		 269 aa  276  4e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  52.57 
 
 		 326 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  56.76 
 
 		 293 aa  275  8e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  53.82 
 
 		 326 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  54.44 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  55.36 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4849  hypothetical protein  64.5 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0355335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  52.14 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  55.93 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  54.66 
 
 		 331 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  53.11 
 
 		 364 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  57.4 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  53.11 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  54.66 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  54.85 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  54.01 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  55.08 
 
 		 365 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  55.51 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  55.27 
 
 		 340 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  52.74 
 
 		 369 aa  268  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  54.85 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  51.49 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  54.66 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  54.66 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  52.92 
 
 		 320 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  58.41 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  51.9 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  57.92 
 
 		 305 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1667  hypothetical protein  58.9 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.157916  normal  0.465786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  51.69 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  56.05 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  52.28 
 
 		 383 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  51.21 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  57.52 
 
 		 304 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  54.32 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  52.42 
 
 		 305 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  52.12 
 
 		 391 aa  261  8e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  51.02 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  55.32 
 
 		 289 aa  260  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  51.75 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  56.31 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  57.21 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  52.34 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  52.97 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  57.08 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  56.31 
 
 		 300 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0369  hypothetical protein  51.79 
 
 		 253 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  56.65 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  55.86 
 
 		 314 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  56.65 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  50.39 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  51.27 
 
 		 324 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  56.31 
 
 		 513 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  52.36 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  53.85 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  54.15 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  55.41 
 
 		 316 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  50.85 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  55.7 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  49.6 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  53.42 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  53.42 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  55.86 
 
 		 316 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  56.31 
 
 		 308 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  56.31 
 
 		 308 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  56.31 
 
 		 308 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  52.81 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  55.86 
 
 		 316 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  55.86 
 
 		 316 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  49.15 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  54.95 
 
 		 316 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  53.39 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  55.86 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  54.24 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  54.55 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  51.91 
 
 		 293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  52.32 
 
 		 340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  55.42 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  55.93 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  55.13 
 
 		 307 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>