More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1514 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1514  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.744458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  74.82 
 
 
287 aa  427  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  79.52 
 
 
286 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  79.52 
 
 
286 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4488  hypothetical protein  75.79 
 
 
286 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.521418  normal  0.0804877 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4523  hypothetical protein  69.75 
 
 
284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.872957  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6004  hypothetical protein  70.88 
 
 
280 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47701  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6193  hypothetical protein  67.46 
 
 
265 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  64.89 
 
 
265 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1410  hypothetical protein  63.67 
 
 
268 aa  340  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0994323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1864  hypothetical protein  62.6 
 
 
263 aa  332  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844813  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0130  hypothetical protein  65.04 
 
 
263 aa  331  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.898159 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  59.84 
 
 
261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  59.84 
 
 
261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  61.67 
 
 
257 aa  305  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  53.66 
 
 
269 aa  275  8e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0369  hypothetical protein  54.88 
 
 
253 aa  269  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  54.51 
 
 
269 aa  269  4e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1667  hypothetical protein  61.75 
 
 
251 aa  269  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.157916  normal  0.465786 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  52.14 
 
 
293 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  49.17 
 
 
263 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4849  hypothetical protein  58.59 
 
 
272 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0355335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  51.05 
 
 
314 aa  263  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  50.98 
 
 
405 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  48.26 
 
 
297 aa  261  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  54.17 
 
 
289 aa  261  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  55.8 
 
 
320 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  49.8 
 
 
365 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  54.2 
 
 
294 aa  258  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  54.09 
 
 
276 aa  257  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  49.41 
 
 
375 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  55.56 
 
 
310 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  56.76 
 
 
305 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  52.94 
 
 
293 aa  256  3e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  52.12 
 
 
293 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  50.84 
 
 
364 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  56.19 
 
 
304 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  49.02 
 
 
383 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  50.42 
 
 
314 aa  254  8e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  54.55 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  54.55 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  57.21 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  47.71 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  52.1 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  52.1 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  54.24 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  52.74 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  51.68 
 
 
338 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  51.68 
 
 
393 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  52.12 
 
 
293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  53.94 
 
 
338 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  56.44 
 
 
322 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  53.91 
 
 
310 aa  252  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  50.21 
 
 
324 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  54.55 
 
 
308 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  50.84 
 
 
301 aa  251  8.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  55.36 
 
 
305 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  50.64 
 
 
300 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  52.1 
 
 
336 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  52.1 
 
 
340 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  49.59 
 
 
299 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  55.46 
 
 
309 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  52.91 
 
 
367 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  52.44 
 
 
310 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  54.94 
 
 
324 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  54.17 
 
 
307 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  50 
 
 
310 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  48.56 
 
 
318 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  55.08 
 
 
324 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  54.15 
 
 
316 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  46.24 
 
 
329 aa  248  9e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  55.86 
 
 
304 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  55.45 
 
 
513 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  55.45 
 
 
316 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  49.6 
 
 
308 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  54.09 
 
 
308 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  52.56 
 
 
337 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  55.45 
 
 
316 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  55.45 
 
 
316 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  55 
 
 
316 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  51.69 
 
 
359 aa  247  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  52.16 
 
 
304 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  55.45 
 
 
314 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  55.41 
 
 
304 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  51.71 
 
 
328 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  55 
 
 
316 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  53.6 
 
 
280 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  53 
 
 
276 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  51.68 
 
 
296 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  52.44 
 
 
306 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  54.95 
 
 
308 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  54.95 
 
 
308 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  54.95 
 
 
308 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  50.42 
 
 
340 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  54.55 
 
 
316 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  54.39 
 
 
307 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  46.9 
 
 
295 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  52.14 
 
 
318 aa  244  9e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  47.41 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>