More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3681 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 311 aa  637    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  72.03 
 
 		 316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  69.77 
 
 		 304 aa  434  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  75.29 
 
 		 303 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  67.8 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  68.53 
 
 		 296 aa  411  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  66.78 
 
 		 318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  64.16 
 
 		 301 aa  401  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  69.17 
 
 		 310 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  64.38 
 
 		 296 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  67.03 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  67.5 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  64.53 
 
 		 299 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  64.34 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  67.86 
 
 		 294 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  67.86 
 
 		 294 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  67.86 
 
 		 294 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  67.82 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  65 
 
 		 364 aa  364  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  65 
 
 		 365 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  65.38 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  66.54 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  63.32 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  66.41 
 
 		 393 aa  361  8e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  65.35 
 
 		 263 aa  361  9e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  60.69 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  66.02 
 
 		 375 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  63.71 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  63.92 
 
 		 329 aa  352  5e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  66.01 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  65.08 
 
 		 338 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  62.45 
 
 		 297 aa  345  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  64.68 
 
 		 340 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  64.68 
 
 		 336 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  61.28 
 
 		 314 aa  345  8e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  64.14 
 
 		 340 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  62.6 
 
 		 357 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  64.11 
 
 		 326 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  62.6 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  61 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  62.5 
 
 		 326 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  62.9 
 
 		 331 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  52.78 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  55.38 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  58.05 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  55.41 
 
 		 281 aa  288  8e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  55.73 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  55.2 
 
 		 289 aa  285  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  54.07 
 
 		 307 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  59.91 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  53.44 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  51.59 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  56.17 
 
 		 305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  57.85 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  50.19 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  55.88 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  54.22 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  59.03 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  53.6 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  53.97 
 
 		 319 aa  278  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  53.97 
 
 		 319 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  50.57 
 
 		 293 aa  278  8e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  48.72 
 
 		 294 aa  278  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  54.11 
 
 		 256 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  57.08 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  54.15 
 
 		 314 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  47.62 
 
 		 293 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  56.14 
 
 		 269 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  57.02 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  56.9 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  58.48 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3195  hypothetical protein  52.46 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0203671  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  52.57 
 
 		 294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  52.69 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  53.08 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  53.08 
 
 		 314 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  53.08 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  53.08 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  56.58 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  52.17 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  52.17 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  57.53 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  55.51 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  53.88 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  55.65 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  52.69 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  56.6 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  53.22 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  52.49 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  53.33 
 
 		 513 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  52.49 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  53.22 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  52.49 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  52.11 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  58.22 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  54.09 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  52.67 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  52.65 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  52.11 
 
 		 308 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  55.02 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>