More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0176 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  100 
 
 
293 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  93.17 
 
 
293 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  75.87 
 
 
300 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  68.88 
 
 
294 aa  418  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  62.46 
 
 
319 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  61.89 
 
 
314 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  62.46 
 
 
319 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  59.58 
 
 
299 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  55.34 
 
 
326 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  53.82 
 
 
357 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  53.75 
 
 
326 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  55.51 
 
 
263 aa  295  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  51.78 
 
 
324 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  53.36 
 
 
331 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  53.41 
 
 
298 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  52.49 
 
 
340 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  52.49 
 
 
336 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  53.41 
 
 
297 aa  292  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  51.34 
 
 
338 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  52.55 
 
 
364 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  47.16 
 
 
314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  51.98 
 
 
310 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  51.17 
 
 
329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  49.28 
 
 
340 aa  285  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  50.19 
 
 
369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3195  hypothetical protein  50.55 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0203671  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  50.59 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  49.64 
 
 
365 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  51.75 
 
 
314 aa  281  7.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  51.87 
 
 
294 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  49.43 
 
 
405 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  53.06 
 
 
296 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  52.23 
 
 
311 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  51.2 
 
 
303 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  52.42 
 
 
304 aa  279  5e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  50.6 
 
 
318 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  51.63 
 
 
316 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  51.61 
 
 
393 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  50.2 
 
 
391 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  48.36 
 
 
383 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  48.99 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  51.82 
 
 
375 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  50.81 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  51.21 
 
 
327 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  50.81 
 
 
310 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  51.84 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  50.57 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  52.82 
 
 
289 aa  269  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  51.01 
 
 
367 aa  268  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  53.39 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  50.2 
 
 
296 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  50.41 
 
 
293 aa  265  5e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  50.81 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  50.81 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  50.81 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  49.58 
 
 
293 aa  263  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  52.47 
 
 
256 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  48.46 
 
 
294 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  46.55 
 
 
359 aa  260  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  53.33 
 
 
288 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  49.59 
 
 
276 aa  259  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  49.79 
 
 
269 aa  258  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  49.14 
 
 
295 aa  257  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  46.15 
 
 
337 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  50.61 
 
 
307 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  52.53 
 
 
285 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  51.11 
 
 
276 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  50.2 
 
 
299 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  49.36 
 
 
320 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  49.2 
 
 
304 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  46.27 
 
 
307 aa  254  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  49.79 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  49.79 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  49.19 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  48.99 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  51.91 
 
 
286 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  51.91 
 
 
286 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04552  transcriptional regulator  53.18 
 
 
260 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.552506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  49 
 
 
265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  52.83 
 
 
258 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  48.58 
 
 
287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1514  hypothetical protein  52.12 
 
 
281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.744458 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  51.54 
 
 
292 aa  252  6e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  48.4 
 
 
304 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6004  hypothetical protein  49.8 
 
 
280 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47701  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  50.21 
 
 
304 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  50.21 
 
 
304 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  50.85 
 
 
318 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  53.92 
 
 
316 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4523  hypothetical protein  50.66 
 
 
284 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.872957  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  49.55 
 
 
281 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  50.84 
 
 
257 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  52.91 
 
 
304 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4488  hypothetical protein  50.22 
 
 
286 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.521418  normal  0.0804877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  52.91 
 
 
305 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  48.98 
 
 
307 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  52.23 
 
 
322 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  51.57 
 
 
280 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  50.84 
 
 
305 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  53.46 
 
 
304 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>