More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3897 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 299 aa  620  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  72.3 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  69.36 
 
 		 310 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  69.28 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  67.8 
 
 		 301 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  64.53 
 
 		 311 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  67.27 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  67.29 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  69.26 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  69.26 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  66.29 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  69.26 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  68.73 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  66.3 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  67.17 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  69.76 
 
 		 297 aa  362  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  65.65 
 
 		 316 aa  362  6e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  65.38 
 
 		 310 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  65.13 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  67.61 
 
 		 314 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  68.42 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  68.42 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  67.21 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  63.24 
 
 		 369 aa  342  4e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  64.37 
 
 		 364 aa  341  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  63.45 
 
 		 405 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  66.67 
 
 		 296 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  60 
 
 		 391 aa  337  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  63.45 
 
 		 393 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  65.57 
 
 		 263 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  58.51 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  58.62 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  60.75 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  63.97 
 
 		 331 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  61.11 
 
 		 329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  63.78 
 
 		 372 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  62.06 
 
 		 383 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  58.76 
 
 		 298 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  63.97 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  58.39 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  63.16 
 
 		 326 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  61.54 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  58.22 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  56.02 
 
 		 276 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  57.08 
 
 		 281 aa  279  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  57.39 
 
 		 285 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  52.23 
 
 		 300 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  55.02 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  56.41 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  55.56 
 
 		 293 aa  275  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  55.6 
 
 		 307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  50.57 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  56 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  54.85 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  52.63 
 
 		 294 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  53.31 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  50.75 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  51.49 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  54.98 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  55.36 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  54.62 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  55.56 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  55.56 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  53.15 
 
 		 307 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  56.33 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  55.46 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  53.06 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  55.32 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  54.35 
 
 		 292 aa  266  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  54.2 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  55.32 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  55 
 
 		 309 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  54.74 
 
 		 305 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  57.53 
 
 		 258 aa  265  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  55.75 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  51.02 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  50.97 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  55.36 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  54.82 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  56.05 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  55.25 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  55.11 
 
 		 316 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  51.18 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  56.36 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  50.21 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  54.51 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  56.28 
 
 		 310 aa  262  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  56.76 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  54.87 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  55.31 
 
 		 513 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  50.41 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  47.27 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  55.26 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  55.75 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  55.26 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  55.26 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  53.19 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  53.68 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  55.31 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  50.21 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>