More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0172 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  100 
 
 
310 aa  638    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  79.32 
 
 
304 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  70.89 
 
 
296 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  69.36 
 
 
299 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  68.37 
 
 
301 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  67.8 
 
 
311 aa  411  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  69.78 
 
 
296 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  64.43 
 
 
316 aa  397  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  68.52 
 
 
318 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  67.04 
 
 
310 aa  378  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  66.67 
 
 
324 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  65.09 
 
 
294 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  65.09 
 
 
294 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  65.09 
 
 
294 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  66.41 
 
 
303 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  65.53 
 
 
328 aa  364  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  65.81 
 
 
327 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  63.18 
 
 
369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  67.06 
 
 
340 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  67.06 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  66.27 
 
 
338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  64.73 
 
 
340 aa  347  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  63.46 
 
 
391 aa  346  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  65.89 
 
 
296 aa  342  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  63.64 
 
 
383 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  59.14 
 
 
329 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  62.99 
 
 
297 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  62.06 
 
 
364 aa  339  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  59.77 
 
 
365 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  63.49 
 
 
405 aa  338  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  59.71 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  62.85 
 
 
263 aa  335  5e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  62.75 
 
 
331 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  62.4 
 
 
314 aa  334  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  59.78 
 
 
314 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  63.67 
 
 
357 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  63.16 
 
 
367 aa  332  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  62.35 
 
 
326 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  63.16 
 
 
326 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  62.35 
 
 
375 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  62.45 
 
 
372 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  63.27 
 
 
298 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  58.74 
 
 
320 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  52.14 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  54.89 
 
 
281 aa  286  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  52.21 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  57.71 
 
 
285 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  53.69 
 
 
294 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  57.34 
 
 
305 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  56.05 
 
 
276 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  54.51 
 
 
276 aa  275  5e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  54.62 
 
 
293 aa  275  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  58.48 
 
 
337 aa  275  7e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  53.19 
 
 
256 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  55.23 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  57.08 
 
 
324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  52.44 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  52.51 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  58.64 
 
 
324 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  54.39 
 
 
304 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  52.65 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  57.59 
 
 
359 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  55.79 
 
 
310 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  53.94 
 
 
307 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  57.4 
 
 
316 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  54.81 
 
 
304 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  55.28 
 
 
305 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  50.81 
 
 
293 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  53.39 
 
 
302 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  55.41 
 
 
304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  55.08 
 
 
304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  55.08 
 
 
304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  56.17 
 
 
338 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  55.86 
 
 
258 aa  269  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  57.58 
 
 
304 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  51.89 
 
 
306 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  55.93 
 
 
309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  54.47 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  50.2 
 
 
294 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  48.69 
 
 
293 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  53.85 
 
 
314 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  53.78 
 
 
284 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  57.14 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  56.95 
 
 
513 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  54.89 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  58.04 
 
 
306 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  56.5 
 
 
310 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  51.91 
 
 
318 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  53.19 
 
 
258 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  53.81 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  55.22 
 
 
305 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  55 
 
 
305 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  49.61 
 
 
289 aa  265  8.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  56.95 
 
 
308 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  49.62 
 
 
293 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  56.95 
 
 
308 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  56.95 
 
 
308 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  54.51 
 
 
308 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  56.05 
 
 
316 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  56.5 
 
 
308 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>