More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0187 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 296 aa  603  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  75.74 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  76.21 
 
 		 316 aa  428  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  74.17 
 
 		 310 aa  421  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  74.9 
 
 		 303 aa  417  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  70.86 
 
 		 304 aa  411  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  73.26 
 
 		 327 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  72.26 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  70.15 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  69.78 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  68.59 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  71.21 
 
 		 294 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  71.21 
 
 		 294 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  66.54 
 
 		 301 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  71.21 
 
 		 294 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  64.87 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  67.27 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  68.97 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  64.39 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  66.93 
 
 		 263 aa  361  9e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  64.62 
 
 		 364 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  68.13 
 
 		 336 aa  358  4e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  65.66 
 
 		 405 aa  359  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  65.38 
 
 		 383 aa  358  5e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  65.64 
 
 		 314 aa  358  8e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  67.73 
 
 		 340 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  64.59 
 
 		 357 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  64.23 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  66.14 
 
 		 338 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  64.02 
 
 		 393 aa  352  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  63.81 
 
 		 326 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  64.34 
 
 		 331 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  65.37 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  64.2 
 
 		 298 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  65.13 
 
 		 375 aa  349  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  58.72 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  64.29 
 
 		 372 aa  346  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  63.92 
 
 		 326 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  62.18 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  61.8 
 
 		 340 aa  341  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  61.66 
 
 		 297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  61.26 
 
 		 314 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  57.68 
 
 		 289 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  56.47 
 
 		 289 aa  296  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  57.45 
 
 		 281 aa  295  9e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  52.67 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  62.39 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  57.87 
 
 		 256 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  56.56 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  61.88 
 
 		 320 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  58.7 
 
 		 288 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  56.75 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  57.79 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  60.09 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  57.94 
 
 		 285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  55.98 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  56.25 
 
 		 337 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  51.39 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  55.74 
 
 		 318 aa  281  8.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  59.46 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  53.06 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  53.06 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  55.47 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  57.01 
 
 		 276 aa  277  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  54.51 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  56.69 
 
 		 307 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  58.01 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  57.45 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  52.92 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  55.66 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  55.7 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  56 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  58.05 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  55.65 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  54.89 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  51.19 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  59.39 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  56.6 
 
 		 258 aa  275  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  54.31 
 
 		 304 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3195  hypothetical protein  51.59 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0203671  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  50.6 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  54.44 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  54.44 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  54.31 
 
 		 304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  58.47 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  58.47 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  60.09 
 
 		 316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  60.17 
 
 		 310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  53.94 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  60.44 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  58.9 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04552  transcriptional regulator  56.54 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.552506  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  58.9 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  58.9 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  60.81 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  60.89 
 
 		 513 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  59.21 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  53.81 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  56.73 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  59.46 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>