More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1088 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  73.48 
 
 		 293 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  70.61 
 
 		 269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  69.85 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  71.83 
 
 		 293 aa  391  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  63.92 
 
 		 284 aa  353  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  63.89 
 
 		 262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  63 
 
 		 405 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  59.35 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  60.34 
 
 		 391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  56.92 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  59.07 
 
 		 375 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  59.07 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  57.92 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  58.65 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  57.49 
 
 		 357 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  54.26 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  57.49 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  58.23 
 
 		 365 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  57.68 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  57.03 
 
 		 314 aa  295  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  58.65 
 
 		 383 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  58.09 
 
 		 329 aa  293  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  57.92 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  55.34 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  57.14 
 
 		 331 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  60.09 
 
 		 320 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  57.81 
 
 		 326 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  55.6 
 
 		 369 aa  291  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  58.85 
 
 		 303 aa  291  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  56.2 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  58.05 
 
 		 311 aa  290  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  56.1 
 
 		 338 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  59.82 
 
 		 336 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  59.82 
 
 		 340 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  60 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  60.52 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  53.46 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  53.82 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  58.85 
 
 		 316 aa  285  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  57.5 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  58.08 
 
 		 256 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  56.02 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  55.65 
 
 		 304 aa  281  8.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  56.56 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  59.36 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  56.64 
 
 		 300 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  58.72 
 
 		 288 aa  278  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  57.99 
 
 		 301 aa  278  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  57.21 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  58.74 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  58.74 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  57.01 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  56.89 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  58.74 
 
 		 316 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  59.36 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  58.22 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  54.51 
 
 		 310 aa  275  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  57.66 
 
 		 310 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  55.51 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  56.44 
 
 		 310 aa  275  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  55.93 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  55.36 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  55.36 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  58.74 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  58.9 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  55.93 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  52.74 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  55.56 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  55.61 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  57.01 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  57.01 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  57.01 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  56.5 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  56.5 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  56 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  58.53 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  56.5 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  54.46 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  57.59 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  56.5 
 
 		 513 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  59.52 
 
 		 258 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  53.42 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  55.91 
 
 		 287 aa  271  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  55.11 
 
 		 281 aa  271  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  56.05 
 
 		 308 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  53.42 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  57.14 
 
 		 318 aa  271  9e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  56.88 
 
 		 305 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  55.11 
 
 		 316 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  57.85 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  54.67 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  56.16 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  54.67 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  53.78 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  54.67 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  56.82 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  54.67 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  50.63 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  56.89 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>