More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004376 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  90.87 
 
 
256 aa  483  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  81.78 
 
 
258 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  73.64 
 
 
288 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  67.97 
 
 
304 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  68.34 
 
 
320 aa  364  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  65.5 
 
 
305 aa  363  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  65.23 
 
 
310 aa  360  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  64.86 
 
 
310 aa  360  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  65.37 
 
 
306 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  63.28 
 
 
280 aa  359  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  65.62 
 
 
304 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  65.64 
 
 
304 aa  358  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  65.64 
 
 
304 aa  358  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  64.06 
 
 
338 aa  358  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  66.54 
 
 
305 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  64.73 
 
 
304 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  64.34 
 
 
304 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  63.95 
 
 
300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  65.62 
 
 
305 aa  356  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  64.57 
 
 
316 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  65.23 
 
 
305 aa  353  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  64.57 
 
 
308 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  64.57 
 
 
316 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  64.57 
 
 
316 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  63.28 
 
 
324 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  62.26 
 
 
337 aa  351  7e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  63.04 
 
 
307 aa  351  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  64.96 
 
 
314 aa  351  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  64.2 
 
 
309 aa  350  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  63.67 
 
 
324 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  61.87 
 
 
359 aa  349  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  63.42 
 
 
322 aa  349  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  64.17 
 
 
304 aa  349  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  64.57 
 
 
316 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  64.57 
 
 
316 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  64.57 
 
 
316 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  63.81 
 
 
307 aa  348  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  63.32 
 
 
316 aa  347  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  62.02 
 
 
301 aa  345  5e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  61.39 
 
 
309 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  62.2 
 
 
308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  60.31 
 
 
292 aa  342  5e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  61.48 
 
 
318 aa  342  5e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  62.99 
 
 
513 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  62.99 
 
 
308 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  62.99 
 
 
308 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  62.99 
 
 
308 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  62.6 
 
 
310 aa  340  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  61.81 
 
 
308 aa  340  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  62.6 
 
 
308 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  63.57 
 
 
300 aa  337  8e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  63.45 
 
 
305 aa  335  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  62.89 
 
 
276 aa  333  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  58.91 
 
 
302 aa  333  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  60.55 
 
 
305 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  59.61 
 
 
281 aa  331  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  61.72 
 
 
295 aa  328  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  60 
 
 
269 aa  328  7e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  64 
 
 
285 aa  327  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  60.16 
 
 
306 aa  325  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  62.65 
 
 
273 aa  322  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  57.85 
 
 
271 aa  318  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  64.29 
 
 
297 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  58.75 
 
 
283 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1564  hypothetical protein  56.03 
 
 
279 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  55.86 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  55.64 
 
 
280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  55.08 
 
 
280 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  55.08 
 
 
280 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  58.59 
 
 
274 aa  310  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  58.14 
 
 
327 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  61.16 
 
 
357 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  60.96 
 
 
314 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  61.16 
 
 
298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  57.75 
 
 
277 aa  308  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  59.14 
 
 
271 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  63.91 
 
 
405 aa  308  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  58.47 
 
 
326 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  59.14 
 
 
271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  60 
 
 
270 aa  305  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  58.4 
 
 
331 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  59.49 
 
 
310 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  60.43 
 
 
296 aa  305  7e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4193  hypothetical protein  56.42 
 
 
278 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  60.43 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  59.82 
 
 
326 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  55.08 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  59.57 
 
 
336 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  61.43 
 
 
340 aa  302  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  61.16 
 
 
263 aa  301  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  59.59 
 
 
272 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4471  hypothetical protein  59.92 
 
 
272 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  59.57 
 
 
340 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3502  hypothetical protein  57.98 
 
 
273 aa  301  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  58.3 
 
 
318 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  58.3 
 
 
338 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  63.51 
 
 
393 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  59.05 
 
 
285 aa  298  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  59.4 
 
 
364 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>