More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0707 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  73.48 
 
 
276 aa  413  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  69.96 
 
 
269 aa  392  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  70.59 
 
 
269 aa  391  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  72.31 
 
 
293 aa  378  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  64.43 
 
 
284 aa  348  5e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0632  hypothetical protein  98.77 
 
 
162 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.543928  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  61.9 
 
 
262 aa  335  3.9999999999999995e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  55.87 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  61.99 
 
 
357 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  62.44 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  59.66 
 
 
405 aa  302  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  59.23 
 
 
364 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  55.08 
 
 
263 aa  300  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  57.94 
 
 
393 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  56.72 
 
 
297 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  61.09 
 
 
331 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  57.51 
 
 
391 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  57.69 
 
 
367 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  60.63 
 
 
326 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  56.41 
 
 
375 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  54.29 
 
 
365 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  55.98 
 
 
324 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  61.01 
 
 
256 aa  291  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  50.74 
 
 
314 aa  290  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  58.37 
 
 
303 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  59.73 
 
 
326 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  54 
 
 
310 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  57.51 
 
 
383 aa  288  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  53.88 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  59.09 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  58.3 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  58.33 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  51.39 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  59.19 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  51.36 
 
 
336 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  51.36 
 
 
340 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  48.72 
 
 
338 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  50.57 
 
 
311 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  55.66 
 
 
296 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  54.7 
 
 
318 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  52.09 
 
 
301 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  56.65 
 
 
372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  50.82 
 
 
300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  56.76 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  56.76 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  50.57 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  51.14 
 
 
304 aa  273  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  56.22 
 
 
288 aa  272  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  56.68 
 
 
258 aa  271  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  55.75 
 
 
316 aa  271  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  54.43 
 
 
296 aa  271  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  54.05 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  55.2 
 
 
294 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  55.2 
 
 
294 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  55.2 
 
 
294 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0633  polyphosphate kinase 2  98.52 
 
 
137 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  52.73 
 
 
265 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  51.98 
 
 
295 aa  267  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  54.38 
 
 
285 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  55.76 
 
 
300 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  50.81 
 
 
328 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  50.41 
 
 
293 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  53.92 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  56.42 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  56.22 
 
 
301 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  49.59 
 
 
293 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  53.64 
 
 
261 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  52.16 
 
 
310 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  49.62 
 
 
310 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  56.22 
 
 
305 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  53.64 
 
 
261 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  55.76 
 
 
307 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  55.76 
 
 
304 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  50 
 
 
304 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  55.76 
 
 
304 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  52.17 
 
 
316 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  53.33 
 
 
300 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  51.29 
 
 
314 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  54.84 
 
 
310 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  52.4 
 
 
304 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4488  hypothetical protein  53.54 
 
 
286 aa  261  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.521418  normal  0.0804877 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  51.08 
 
 
316 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4523  hypothetical protein  53.81 
 
 
284 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.872957  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  53.92 
 
 
305 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  55.3 
 
 
318 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  51.08 
 
 
316 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  55.76 
 
 
292 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  48.57 
 
 
281 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  51.52 
 
 
316 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  52.53 
 
 
305 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  51.52 
 
 
316 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  51.52 
 
 
316 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  55.76 
 
 
305 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  51.29 
 
 
513 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3368  hypothetical protein  50.41 
 
 
309 aa  258  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0275046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  52.89 
 
 
324 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  54.84 
 
 
324 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  51.29 
 
 
308 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  51.29 
 
 
308 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>