More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0497 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  68.17 
 
 		 300 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  68.88 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  68.88 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  63.64 
 
 		 299 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  60.07 
 
 		 314 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  58.68 
 
 		 319 aa  351  7e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  58.68 
 
 		 319 aa  351  7e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  53.33 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  53.17 
 
 		 310 aa  295  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  50.56 
 
 		 365 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  50.94 
 
 		 405 aa  292  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  53.36 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  52.12 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  52.12 
 
 		 336 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  51.17 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  55.02 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  50.18 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  51.39 
 
 		 318 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  54.22 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  50.58 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  54.55 
 
 		 326 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  52.96 
 
 		 298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  49.81 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  50.38 
 
 		 340 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  50.77 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  49.42 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  49.43 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  51.59 
 
 		 375 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  52.59 
 
 		 304 aa  280  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  50.19 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  51.43 
 
 		 301 aa  278  5e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  50 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  50 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  51.01 
 
 		 391 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  50.6 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3195  hypothetical protein  49.08 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0203671  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  52.63 
 
 		 299 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  48.06 
 
 		 294 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  50.81 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  50.19 
 
 		 372 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  50.4 
 
 		 367 aa  271  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  49.6 
 
 		 314 aa  271  7e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  51.19 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  47.92 
 
 		 383 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  50.2 
 
 		 310 aa  268  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  49 
 
 		 296 aa  265  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  46.52 
 
 		 328 aa  265  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  48.45 
 
 		 289 aa  265  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  51.01 
 
 		 294 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  51.01 
 
 		 294 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  51.01 
 
 		 294 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  47.69 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  47.58 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  48.57 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  50.89 
 
 		 281 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  50.66 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  49.01 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04552  transcriptional regulator  53.92 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.552506  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  50.43 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  47.76 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  48.55 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  50.22 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  51.3 
 
 		 304 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  47.31 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  48.55 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  46.77 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  47.64 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  50.67 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  50.87 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6004  hypothetical protein  48 
 
 		 280 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  49.14 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  49.59 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  51.48 
 
 		 305 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  51.12 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  51.08 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  48.07 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1514  hypothetical protein  50 
 
 		 281 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.744458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  52.02 
 
 		 304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  52.02 
 
 		 304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  51.77 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  50.43 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  49.78 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  46.22 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  46.4 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  46.46 
 
 		 265 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  48.56 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  51.38 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  46.96 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  49.57 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  48 
 
 		 262 aa  242  7e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  49.77 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  44.84 
 
 		 294 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2307  hypothetical protein  50 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.127828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  51.57 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  47.64 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  47.64 
 
 		 280 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  51.57 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  50.45 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  48.73 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>