More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1381 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  592  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  67.13 
 
 		 289 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  64.11 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  63.76 
 
 		 294 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  65.16 
 
 		 294 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  63.07 
 
 		 294 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  58.89 
 
 		 307 aa  352  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  57.79 
 
 		 314 aa  309  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  59.59 
 
 		 316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  53.21 
 
 		 326 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  52.86 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  56.33 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  58.46 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  52.16 
 
 		 331 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  56.22 
 
 		 263 aa  298  7e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  56.56 
 
 		 310 aa  298  8e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  56.03 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  56.18 
 
 		 303 aa  298  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  54.78 
 
 		 393 aa  298  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  57.32 
 
 		 364 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  56.47 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  54.62 
 
 		 357 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  54.62 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  56.42 
 
 		 365 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  54.86 
 
 		 324 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  55.38 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  56.8 
 
 		 391 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  52.94 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  54.41 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  54.86 
 
 		 383 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  53.49 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  56.1 
 
 		 327 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  50.94 
 
 		 314 aa  285  8e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  48.94 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  52.27 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  56.33 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  56.33 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  55.74 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  54.69 
 
 		 338 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  54.08 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  50.19 
 
 		 340 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  54.58 
 
 		 293 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  53.47 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  53.47 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  53.47 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  49.64 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  51.54 
 
 		 367 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  52.46 
 
 		 297 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  56.33 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  52.87 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  52.82 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  48.45 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  49.81 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  50.97 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  54.55 
 
 		 284 aa  261  6.999999999999999e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  57.4 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  49.44 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  56.95 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  47.89 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  49.44 
 
 		 316 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  51.23 
 
 		 310 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  49.44 
 
 		 316 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  50.35 
 
 		 314 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  49.44 
 
 		 316 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  49.07 
 
 		 316 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  53.23 
 
 		 322 aa  256  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  48.41 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  54.11 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3195  hypothetical protein  48 
 
 		 309 aa  255  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0203671  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  53.62 
 
 		 310 aa  255  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  54.22 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  53.23 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  53.19 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  53.23 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  54.46 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  52.89 
 
 		 281 aa  252  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  51.68 
 
 		 261 aa  252  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  51.82 
 
 		 305 aa  252  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  51.68 
 
 		 261 aa  252  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  53.68 
 
 		 316 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  49.79 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  53.19 
 
 		 513 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  51.93 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  53.19 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  53.19 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  53.74 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  53.19 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  51.52 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  51.05 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  55.25 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  52.77 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  50 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  53.78 
 
 		 305 aa  248  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  53.22 
 
 		 305 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  56.22 
 
 		 300 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  57.08 
 
 		 300 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  54.02 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  54.02 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  51.98 
 
 		 302 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  49.79 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>