More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4500 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  620  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  72.28 
 
 		 294 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  71.93 
 
 		 294 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  70.32 
 
 		 294 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  61.13 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  60.56 
 
 		 289 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  58.89 
 
 		 289 aa  352  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  54.07 
 
 		 311 aa  285  8e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  53.04 
 
 		 299 aa  281  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  54.12 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  52.85 
 
 		 303 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  51.41 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  50.59 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  51.81 
 
 		 326 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  51.23 
 
 		 314 aa  275  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  52.21 
 
 		 331 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  51 
 
 		 298 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  49.46 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  53.28 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  51 
 
 		 326 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  50.18 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  52.87 
 
 		 318 aa  271  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  50 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  51.39 
 
 		 375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  44 
 
 		 329 aa  268  8.999999999999999e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  51.59 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  51.22 
 
 		 365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  50.6 
 
 		 393 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  53.66 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  50.6 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  53.66 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  50.81 
 
 		 364 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  47.3 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  51.19 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  54.07 
 
 		 314 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  49.42 
 
 		 296 aa  263  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  50.2 
 
 		 316 aa  261  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  50.21 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  50 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  50.61 
 
 		 293 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  46.97 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  51.79 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  47.67 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  49.39 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  49.01 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  49.8 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  49.8 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  49.8 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  49.39 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  46.94 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  49.39 
 
 		 336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  44.19 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  47.76 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  48.78 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  50.85 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  48.56 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  48.5 
 
 		 293 aa  249  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  47.56 
 
 		 265 aa  248  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  48.05 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04552  transcriptional regulator  53.67 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.552506  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  43.94 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  52.47 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  45.21 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  47.3 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  47.29 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  47.23 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  47.23 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  48.03 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  45.65 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  50.9 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3195  hypothetical protein  47.13 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0203671  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  46.21 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  45.56 
 
 		 299 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  46.21 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  46.21 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  46.84 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  46.21 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  48.09 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  48.09 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  47.29 
 
 		 305 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  51.74 
 
 		 513 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  43.86 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  49.34 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  46.59 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  52.97 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1514  hypothetical protein  46.99 
 
 		 281 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.744458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1864  hypothetical protein  47.92 
 
 		 263 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844813  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  47.13 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  46.64 
 
 		 310 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  47.06 
 
 		 324 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  45.82 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  44.6 
 
 		 308 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  43.52 
 
 		 314 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  47.37 
 
 		 292 aa  236  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1410  hypothetical protein  45.27 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0994323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  43.33 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  46.67 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  48.95 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  47.88 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  50.88 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>