More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0297 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  88.82 
 
 
314 aa  534  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  68.07 
 
 
299 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  64.04 
 
 
300 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  62.46 
 
 
293 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  61.05 
 
 
293 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  58.48 
 
 
294 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  58.2 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  53.93 
 
 
405 aa  315  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  58.47 
 
 
263 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  54.31 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  48.34 
 
 
331 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  56.18 
 
 
324 aa  309  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  56.05 
 
 
301 aa  308  9e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  52.65 
 
 
310 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  53.94 
 
 
375 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  47.35 
 
 
326 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  51.57 
 
 
369 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3195  hypothetical protein  48.05 
 
 
309 aa  301  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0203671  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  48.46 
 
 
357 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  50.94 
 
 
391 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  52.67 
 
 
393 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  52.17 
 
 
383 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  57.09 
 
 
304 aa  298  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  53.54 
 
 
311 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  47.46 
 
 
326 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  56.18 
 
 
372 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  52.99 
 
 
329 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  52.29 
 
 
314 aa  296  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  51.5 
 
 
297 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  51.31 
 
 
340 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  56.33 
 
 
294 aa  295  6e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  53.63 
 
 
316 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  50.94 
 
 
336 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  54.8 
 
 
296 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  53.85 
 
 
298 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  53.41 
 
 
367 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  51.35 
 
 
296 aa  292  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  50.96 
 
 
338 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  51.34 
 
 
328 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  51.8 
 
 
327 aa  291  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  53.88 
 
 
314 aa  291  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  51.97 
 
 
318 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  53.85 
 
 
294 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  53.85 
 
 
294 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  53.85 
 
 
294 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  53.6 
 
 
289 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  50.38 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  53.66 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  52.8 
 
 
303 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  51.82 
 
 
310 aa  278  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  53.23 
 
 
289 aa  276  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  54.11 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  56 
 
 
256 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  50.59 
 
 
294 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  52.02 
 
 
296 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  54.46 
 
 
276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  51.43 
 
 
294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  53.97 
 
 
304 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  51.02 
 
 
294 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  54.5 
 
 
285 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  53.14 
 
 
304 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  49.63 
 
 
307 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  51.01 
 
 
299 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  51.54 
 
 
295 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  49.25 
 
 
359 aa  264  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  50.2 
 
 
305 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  51.69 
 
 
269 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  53.85 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  49.62 
 
 
337 aa  261  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  50.2 
 
 
324 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  57.14 
 
 
316 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  53.57 
 
 
320 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  47.06 
 
 
324 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  51.97 
 
 
292 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  53.22 
 
 
305 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  51.35 
 
 
338 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  53.57 
 
 
288 aa  258  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  49.24 
 
 
308 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  54.26 
 
 
304 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  54.26 
 
 
304 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  51.97 
 
 
322 aa  258  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04552  transcriptional regulator  53.81 
 
 
260 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.552506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  56.22 
 
 
304 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  51.88 
 
 
302 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  52.08 
 
 
305 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  52.44 
 
 
258 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  55.76 
 
 
304 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  49.4 
 
 
304 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  53.67 
 
 
258 aa  255  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  55.96 
 
 
307 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  47.71 
 
 
308 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  48.83 
 
 
310 aa  254  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  47.71 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  48.83 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  55.05 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  55.25 
 
 
309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  50.8 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  50 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>