More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0013 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  98.98 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  85.03 
 
 		 294 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  72.28 
 
 		 307 aa  418  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  63.76 
 
 		 289 aa  398  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  64.36 
 
 		 294 aa  391  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  64.46 
 
 		 289 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  54.92 
 
 		 310 aa  278  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  53.82 
 
 		 326 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  51.37 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  53.41 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  52.65 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  54.03 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  52.59 
 
 		 405 aa  271  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  53.82 
 
 		 331 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  52.17 
 
 		 311 aa  270  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  52.61 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  49.06 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  52.14 
 
 		 318 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  50.61 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  52.21 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  50.38 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  51.98 
 
 		 327 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  53.06 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  54.89 
 
 		 305 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  51.82 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  50.41 
 
 		 314 aa  265  8.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  50.58 
 
 		 303 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  52.34 
 
 		 393 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  55.61 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  52.4 
 
 		 391 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  48.16 
 
 		 329 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  51.75 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  55.61 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  51.55 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  51.43 
 
 		 304 aa  261  6.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  55.27 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  51.34 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  51.34 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  51.34 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  56.39 
 
 		 513 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  54.55 
 
 		 316 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  54.85 
 
 		 316 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  51.21 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  53.81 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  49.02 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  50.96 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  54.43 
 
 		 316 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  54.43 
 
 		 316 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  54.43 
 
 		 316 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  49.21 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  50.19 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  55.51 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  46.99 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  50.19 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  49.59 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  49.19 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  48.85 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  49.22 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  52.77 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  50.61 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  50.61 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  50.61 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  48.99 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  51.05 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  50.63 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  51.06 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  50.63 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  49.22 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  51.06 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  50.75 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  53.57 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  56.36 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  52.7 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  46.07 
 
 		 314 aa  251  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  51.27 
 
 		 338 aa  251  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  51.71 
 
 		 306 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  51.87 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  49.8 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  51.52 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  53.85 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  51.27 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  51.27 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  51.27 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  47.33 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  52.92 
 
 		 300 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  51.07 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  51.91 
 
 		 256 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  48.58 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  49.39 
 
 		 336 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  52.04 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  53.12 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  51.02 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  53.85 
 
 		 309 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  51.84 
 
 		 314 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  51.02 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  49.39 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  51.06 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  50 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  43.82 
 
 		 301 aa  245  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>