More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04552 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04552  transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.552506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0718  protein of unknown function DUF344  73.36 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15403  normal  0.613775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3677  hypothetical protein  65.74 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  58.8 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  54.4 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  54.4 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  54.58 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  51.36 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  57.08 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  56.25 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  57.08 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  57.08 
 
 		 310 aa  279  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  55.2 
 
 		 316 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  55.2 
 
 		 316 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  55.2 
 
 		 316 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  54.47 
 
 		 359 aa  277  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  55.56 
 
 		 324 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  55.36 
 
 		 337 aa  277  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  55.6 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  52.34 
 
 		 324 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  54.4 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  54 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  54.94 
 
 		 304 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  55.32 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  56.71 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  56.71 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  53.6 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  54.77 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  56.22 
 
 		 322 aa  272  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  53.39 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  51.95 
 
 		 304 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  53.63 
 
 		 310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  50.59 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  53.39 
 
 		 305 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  51.27 
 
 		 281 aa  271  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  56.54 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  54.51 
 
 		 338 aa  271  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  57.14 
 
 		 307 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  54.95 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  55.41 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  55.41 
 
 		 326 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  53.39 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  56.28 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  56.28 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  56.28 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  54.95 
 
 		 298 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  55.41 
 
 		 300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  53.01 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  52.34 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  54.51 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  54.08 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  52.14 
 
 		 305 aa  268  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  54.55 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  55.84 
 
 		 308 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  56.05 
 
 		 383 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  52.21 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  50.8 
 
 		 326 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  53.25 
 
 		 308 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  52.92 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  50.59 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  52.63 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  56.28 
 
 		 513 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  51.06 
 
 		 263 aa  265  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  51.91 
 
 		 301 aa  265  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  55.2 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  55.91 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  52.81 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  49.58 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  50.42 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  54.51 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  54.71 
 
 		 391 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  55.35 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  52.02 
 
 		 369 aa  262  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  53.64 
 
 		 311 aa  262  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  52.99 
 
 		 297 aa  262  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  52.56 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  57.21 
 
 		 300 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  54.55 
 
 		 314 aa  261  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  55.5 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  52.32 
 
 		 316 aa  260  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  49.03 
 
 		 276 aa  259  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  52.74 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  54.75 
 
 		 405 aa  259  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  56.62 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  51.93 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  54.75 
 
 		 365 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  53.18 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  51.68 
 
 		 314 aa  259  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  54.79 
 
 		 367 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  53.59 
 
 		 336 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  52.54 
 
 		 340 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  55.45 
 
 		 340 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  54.34 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  53.39 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  53.64 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  53.92 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  50.63 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  52.12 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  52.12 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  52.12 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>