More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1297 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  100 
 
 
280 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  83.57 
 
 
280 aa  485  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6914  protein of unknown function DUF344  76.79 
 
 
280 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1564  hypothetical protein  74.64 
 
 
279 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  68.99 
 
 
277 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  63.24 
 
 
271 aa  371  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  59.26 
 
 
283 aa  335  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3502  hypothetical protein  59 
 
 
273 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  59.85 
 
 
274 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1170  protein of unknown function DUF344  58.09 
 
 
278 aa  328  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0866985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1707  hypothetical protein  59.77 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00527204  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4120  protein of unknown function DUF344  57.3 
 
 
277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.794478  hitchhiker  0.00182923 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4193  hypothetical protein  59.77 
 
 
278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  57.99 
 
 
274 aa  323  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  62.34 
 
 
270 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  62.35 
 
 
281 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  61.69 
 
 
285 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2307  hypothetical protein  60 
 
 
276 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.127828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  60.39 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4471  hypothetical protein  57.2 
 
 
272 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  55.47 
 
 
258 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  60.34 
 
 
288 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  57.51 
 
 
271 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  57.51 
 
 
271 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  56.83 
 
 
272 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  56.9 
 
 
256 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  54.72 
 
 
305 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  56.2 
 
 
305 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  55.38 
 
 
304 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  55.38 
 
 
304 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  55.74 
 
 
305 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  56.38 
 
 
513 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  56.9 
 
 
310 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  57.32 
 
 
308 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  57.32 
 
 
308 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  57.32 
 
 
308 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  57.32 
 
 
308 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  55.33 
 
 
304 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  54.03 
 
 
359 aa  295  7e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  54.03 
 
 
337 aa  295  8e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  54.1 
 
 
258 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  59.73 
 
 
320 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  53.73 
 
 
309 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  55.65 
 
 
316 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  54.92 
 
 
316 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  54.81 
 
 
308 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  53.41 
 
 
301 aa  291  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  55.65 
 
 
300 aa  291  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  54.96 
 
 
281 aa  291  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  54.1 
 
 
338 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  54.15 
 
 
309 aa  291  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  54.55 
 
 
304 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  54.55 
 
 
304 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  55.6 
 
 
310 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  52.65 
 
 
322 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  51.74 
 
 
292 aa  289  3e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  54.22 
 
 
306 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  51.75 
 
 
302 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  56.43 
 
 
276 aa  288  9e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  53.66 
 
 
307 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  55.23 
 
 
314 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  53.97 
 
 
308 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  50.55 
 
 
324 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  53.97 
 
 
308 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  54.81 
 
 
316 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  51.29 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  51.56 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  55.23 
 
 
316 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  55.23 
 
 
316 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  55.23 
 
 
316 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  54.03 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  51.11 
 
 
280 aa  284  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  51.95 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  53.82 
 
 
305 aa  283  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  54.73 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  51.17 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  54.39 
 
 
316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  51.18 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  51.55 
 
 
304 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  54.89 
 
 
327 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  58.6 
 
 
300 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  54.32 
 
 
310 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  55.98 
 
 
304 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  53.28 
 
 
304 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  56.09 
 
 
285 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  51.13 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  51.84 
 
 
305 aa  271  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  52.79 
 
 
364 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  54.87 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  54.74 
 
 
383 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  54.67 
 
 
393 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  53.22 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  51.12 
 
 
357 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  49.61 
 
 
329 aa  268  8.999999999999999e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  55.41 
 
 
405 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  51.12 
 
 
298 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  52.77 
 
 
296 aa  265  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  51.28 
 
 
263 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>