More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0369 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0369  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  520  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1514  hypothetical protein  54.88 
 
 
281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.744458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  51.22 
 
 
265 aa  264  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  52.38 
 
 
287 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6004  hypothetical protein  51.41 
 
 
280 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47701  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  51.79 
 
 
286 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  51.79 
 
 
286 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0130  hypothetical protein  51.42 
 
 
263 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.898159 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4488  hypothetical protein  51.2 
 
 
286 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.521418  normal  0.0804877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1410  hypothetical protein  49.19 
 
 
268 aa  255  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0994323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1864  hypothetical protein  52.63 
 
 
263 aa  253  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844813  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  47.5 
 
 
293 aa  250  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4523  hypothetical protein  50.83 
 
 
284 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.872957  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  50.68 
 
 
269 aa  246  3e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  46.22 
 
 
261 aa  245  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  46.22 
 
 
261 aa  245  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  49.78 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  47.56 
 
 
276 aa  241  7e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6193  hypothetical protein  47.39 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  48.1 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  48.54 
 
 
257 aa  234  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  48.5 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  49.15 
 
 
310 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  47.44 
 
 
303 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1667  hypothetical protein  49.34 
 
 
251 aa  232  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.157916  normal  0.465786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  54.25 
 
 
310 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  46.95 
 
 
293 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  46.47 
 
 
295 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  46.84 
 
 
301 aa  229  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  53.05 
 
 
316 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  48.83 
 
 
284 aa  230  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  48.15 
 
 
262 aa  230  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  46.64 
 
 
297 aa  229  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  53.3 
 
 
324 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  46.78 
 
 
329 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  46.75 
 
 
294 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  51.17 
 
 
405 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  46.75 
 
 
294 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  50.64 
 
 
302 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  46.75 
 
 
294 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  49.31 
 
 
285 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  53.77 
 
 
324 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  53.3 
 
 
308 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  53.3 
 
 
308 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  53.3 
 
 
308 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  53.3 
 
 
308 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  53.3 
 
 
513 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  44.54 
 
 
263 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  47.01 
 
 
316 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  44.35 
 
 
314 aa  226  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  45.53 
 
 
357 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  48.58 
 
 
281 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  49.53 
 
 
311 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  45.53 
 
 
298 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  50.22 
 
 
304 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  51.89 
 
 
300 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  51.89 
 
 
305 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  49.79 
 
 
308 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  47.64 
 
 
338 aa  224  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  43.15 
 
 
310 aa  224  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  53.3 
 
 
304 aa  224  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  53.3 
 
 
304 aa  224  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  48.91 
 
 
337 aa  224  8e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  51.47 
 
 
319 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  47.44 
 
 
305 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  51.89 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  48.84 
 
 
300 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  51.47 
 
 
319 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  52.36 
 
 
305 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  51.89 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  48.07 
 
 
327 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  51.89 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  51.89 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  46.28 
 
 
269 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  51.42 
 
 
300 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  48.47 
 
 
359 aa  223  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  51.89 
 
 
314 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  48.13 
 
 
369 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  51.89 
 
 
316 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  50.23 
 
 
383 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  52.83 
 
 
338 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  49.53 
 
 
292 aa  223  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  47.64 
 
 
340 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  45.67 
 
 
274 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  52.58 
 
 
306 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  50.94 
 
 
304 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  47.64 
 
 
336 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  51.89 
 
 
304 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  47.64 
 
 
391 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  48.07 
 
 
340 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  50 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  51.42 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  49.3 
 
 
365 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  44.44 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  50.7 
 
 
288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  53.3 
 
 
309 aa  221  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  46.72 
 
 
273 aa  221  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  51.15 
 
 
316 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  50.9 
 
 
307 aa  221  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  51.89 
 
 
308 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>