More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4488 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4488  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  590  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.521418  normal  0.0804877 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4523  hypothetical protein  74.74 
 
 		 284 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.872957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  71.17 
 
 		 286 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2697  hypothetical protein  69.34 
 
 		 287 aa  410  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  71.17 
 
 		 286 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1514  hypothetical protein  75.79 
 
 		 281 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.744458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6004  hypothetical protein  62.59 
 
 		 280 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6193  hypothetical protein  62.26 
 
 		 265 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  65.69 
 
 		 265 aa  342  5e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1410  hypothetical protein  62.55 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0994323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1864  hypothetical protein  61.9 
 
 		 263 aa  328  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844813  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  61.38 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  61.38 
 
 		 261 aa  316  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  60.74 
 
 		 257 aa  309  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0130  hypothetical protein  60.17 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.898159 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4849  hypothetical protein  65.28 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0355335 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  54.74 
 
 		 269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  54.31 
 
 		 269 aa  268  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1667  hypothetical protein  53.91 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.157916  normal  0.465786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  49.79 
 
 		 314 aa  262  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  53.54 
 
 		 293 aa  261  8e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  53.02 
 
 		 405 aa  260  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  52.36 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  51.26 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  47.73 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  52.47 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  51.11 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0369  hypothetical protein  51.2 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  46.89 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  53.28 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  53.78 
 
 		 289 aa  254  9e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  49 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  52.89 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  50.43 
 
 		 393 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  52.89 
 
 		 336 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  50.21 
 
 		 383 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  50.88 
 
 		 375 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  48.06 
 
 		 357 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  51.72 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  48.5 
 
 		 300 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0286  polyphosphate kinase 2 family protein  50.4 
 
 		 513 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  54.3 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  54.3 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  51.8 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  50.43 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  50.65 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  52.25 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  50.22 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  47.08 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  48.35 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  54.34 
 
 		 305 aa  248  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  46.99 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  52.86 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  54.3 
 
 		 308 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  54.3 
 
 		 308 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  54.3 
 
 		 308 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  45.65 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  53.85 
 
 		 314 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  49.35 
 
 		 326 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  47.21 
 
 		 263 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  48.1 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  53.39 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  47.67 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  50.62 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  51.43 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  49.41 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  53.85 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  50.67 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  53.42 
 
 		 304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  54.35 
 
 		 338 aa  245  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  52.94 
 
 		 316 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  52.42 
 
 		 288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  53.42 
 
 		 304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  50.21 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4019  protein of unknown function DUF344  52.72 
 
 		 306 aa  244  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  51.54 
 
 		 300 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  50 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  53.39 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4175  hypothetical protein  53.39 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4191  hypothetical protein  53.39 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  50.87 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  48.05 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  52.49 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  48.29 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  56.22 
 
 		 310 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  52.04 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  52.48 
 
 		 324 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  52.49 
 
 		 305 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  47.88 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  52.49 
 
 		 308 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1774  hypothetical protein  55.2 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  46.61 
 
 		 316 aa  242  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  49.33 
 
 		 262 aa  242  6e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  47.7 
 
 		 303 aa  242  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  49.12 
 
 		 367 aa  241  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  54.59 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  52.05 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  44.13 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  50.44 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  52.94 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>