More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1080 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  63.06 
 
 		 549 aa  701    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  92.92 
 
 		 535 aa  1002    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1072    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  46.04 
 
 		 497 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  44.78 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  42.78 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  42.78 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  42.72 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  41.56 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  40.07 
 
 		 502 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  42.23 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  41.56 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  41.86 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  40.91 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  40.3 
 
 		 498 aa  385  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.47 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  41.49 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.07 
 
 		 534 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  40.41 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  40.68 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  39.32 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  38.72 
 
 		 544 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  38.53 
 
 		 496 aa  363  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  37.99 
 
 		 497 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.41 
 
 		 497 aa  361  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  37.8 
 
 		 497 aa  359  8e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  37.62 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  38.33 
 
 		 495 aa  352  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  38.2 
 
 		 521 aa  349  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  37.69 
 
 		 497 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  36.96 
 
 		 496 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.95 
 
 		 504 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.07 
 
 		 499 aa  342  8e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  37.29 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  36.02 
 
 		 609 aa  339  8e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  37.01 
 
 		 498 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  36.21 
 
 		 578 aa  334  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  35.19 
 
 		 549 aa  333  4e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  36.64 
 
 		 498 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  38.49 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  33.94 
 
 		 492 aa  310  4e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  33.85 
 
 		 474 aa  302  9e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  58.9 
 
 		 288 aa  280  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.54 
 
 		 270 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  52.54 
 
 		 270 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.54 
 
 		 270 aa  256  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  52.54 
 
 		 254 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  52.54 
 
 		 254 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  52.36 
 
 		 270 aa  256  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  52.54 
 
 		 270 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  54.51 
 
 		 267 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  53.39 
 
 		 270 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  54.13 
 
 		 258 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  54.08 
 
 		 267 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  54.58 
 
 		 264 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  52.59 
 
 		 270 aa  243  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  46.47 
 
 		 308 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  32.05 
 
 		 556 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  51.44 
 
 		 259 aa  237  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  31.87 
 
 		 556 aa  236  9e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  30.38 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  47.95 
 
 		 279 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  53.14 
 
 		 263 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  49.54 
 
 		 261 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  43.95 
 
 		 305 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  41.18 
 
 		 320 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  44.14 
 
 		 258 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  42.48 
 
 		 301 aa  180  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  43.72 
 
 		 405 aa  180  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  41.67 
 
 		 288 aa  180  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  42.34 
 
 		 256 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  36.36 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  40.54 
 
 		 309 aa  177  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  43.98 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  39.69 
 
 		 280 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  38.67 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  41.55 
 
 		 276 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  43.26 
 
 		 305 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  39.38 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  41.83 
 
 		 270 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  42.01 
 
 		 269 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  40.54 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  39.39 
 
 		 289 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  43.46 
 
 		 294 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  42.53 
 
 		 304 aa  174  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  42.53 
 
 		 304 aa  174  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  42.04 
 
 		 304 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  40.17 
 
 		 338 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  42.41 
 
 		 324 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  39.91 
 
 		 292 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  41.63 
 
 		 280 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  41.63 
 
 		 280 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  41.67 
 
 		 316 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  41.78 
 
 		 310 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  41.86 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  39.17 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  43.98 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  38.57 
 
 		 262 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  43.32 
 
 		 302 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  42.27 
 
 		 285 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>