More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1749 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  536  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  67.19 
 
 
261 aa  361  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  48.95 
 
 
308 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  52.94 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  51.36 
 
 
497 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  44.14 
 
 
279 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  52.73 
 
 
493 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  52.56 
 
 
549 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  50.45 
 
 
491 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  51.83 
 
 
270 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  51.8 
 
 
532 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.38 
 
 
270 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  52.33 
 
 
494 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  51.38 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.38 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  51.38 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  51.38 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.38 
 
 
267 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  51.38 
 
 
270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.38 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  48.18 
 
 
496 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  48.18 
 
 
496 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  50.91 
 
 
535 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  50.46 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  49.55 
 
 
497 aa  211  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.42 
 
 
501 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  50 
 
 
498 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  47.95 
 
 
496 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  54.17 
 
 
270 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  46.41 
 
 
556 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.78 
 
 
502 aa  205  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  49.77 
 
 
578 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  51.03 
 
 
495 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  46.61 
 
 
486 aa  205  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  48.78 
 
 
490 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  52.36 
 
 
534 aa  204  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  46.58 
 
 
498 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.61 
 
 
551 aa  203  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  47.03 
 
 
544 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  45.69 
 
 
496 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  46.58 
 
 
474 aa  202  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  46.36 
 
 
497 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  47.03 
 
 
498 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  48.61 
 
 
609 aa  201  8e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  51.3 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  51.83 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  46.12 
 
 
497 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.75 
 
 
497 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  46.81 
 
 
496 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  45 
 
 
490 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  45.45 
 
 
497 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  45.45 
 
 
497 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  46.41 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.66 
 
 
504 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  43.4 
 
 
495 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.36 
 
 
499 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  41.73 
 
 
556 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  46.02 
 
 
496 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  44.93 
 
 
494 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  43.4 
 
 
492 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  46.19 
 
 
494 aa  188  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  46.08 
 
 
549 aa  183  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  44.39 
 
 
492 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  42.13 
 
 
280 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  39.17 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  41.63 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  41.4 
 
 
359 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  40.26 
 
 
306 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  40.61 
 
 
302 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  37.8 
 
 
288 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3677  hypothetical protein  39.41 
 
 
274 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  39.91 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  43.46 
 
 
521 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  38.79 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  39.63 
 
 
256 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  39.21 
 
 
292 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  38.77 
 
 
318 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  36.22 
 
 
270 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  38.89 
 
 
271 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  41.09 
 
 
258 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1892  hypothetical protein  34.55 
 
 
261 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1566  protein of unknown function DUF344  34.55 
 
 
261 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  38.89 
 
 
258 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  38.53 
 
 
304 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  38.33 
 
 
308 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 
308 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  38.33 
 
 
308 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  40.95 
 
 
297 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 
308 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  38.33 
 
 
310 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  37.45 
 
 
269 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  40.5 
 
 
304 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  38.6 
 
 
338 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  40.5 
 
 
304 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  36.97 
 
 
281 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  37.67 
 
 
324 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  37.21 
 
 
324 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  39.07 
 
 
320 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  41.1 
 
 
284 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  42.41 
 
 
347 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>