More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01720 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1125    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  55.21 
 
 		 578 aa  590  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  47.85 
 
 		 609 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  38.69 
 
 		 486 aa  372  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  38.7 
 
 		 497 aa  362  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  35.15 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  36.01 
 
 		 549 aa  346  8e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  35.21 
 
 		 535 aa  343  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  35.21 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  33.94 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  36.26 
 
 		 497 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  34.12 
 
 		 490 aa  332  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  33.51 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  34.12 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  34.12 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  35.53 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.1 
 
 		 504 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  34.91 
 
 		 498 aa  324  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  35.16 
 
 		 497 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  35.04 
 
 		 497 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  35.64 
 
 		 496 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  35.28 
 
 		 544 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  35.78 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  35.08 
 
 		 498 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  34.91 
 
 		 496 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.26 
 
 		 534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  34.9 
 
 		 495 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.35 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  34.12 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  34.05 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  32.97 
 
 		 491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  35.33 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  33.81 
 
 		 495 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  35.04 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.65 
 
 		 499 aa  296  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  34.73 
 
 		 490 aa  294  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  33.77 
 
 		 494 aa  289  8e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  33.4 
 
 		 474 aa  286  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  33.88 
 
 		 521 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  31.35 
 
 		 492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  30.06 
 
 		 556 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  32.14 
 
 		 496 aa  240  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  29.03 
 
 		 556 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  54.04 
 
 		 497 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  30.62 
 
 		 551 aa  231  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.91 
 
 		 267 aa  226  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.91 
 
 		 267 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.78 
 
 		 270 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.78 
 
 		 270 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  49.78 
 
 		 270 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  47.75 
 
 		 288 aa  223  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  49.78 
 
 		 254 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  49.78 
 
 		 254 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  49.78 
 
 		 270 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  49.78 
 
 		 270 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  50 
 
 		 270 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  48.12 
 
 		 259 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  50 
 
 		 270 aa  213  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  44.21 
 
 		 258 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  50 
 
 		 264 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  45.45 
 
 		 308 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  44.95 
 
 		 261 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  40.17 
 
 		 279 aa  183  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  48.95 
 
 		 263 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  38.39 
 
 		 263 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  38.01 
 
 		 303 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  37.56 
 
 		 318 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  38.91 
 
 		 324 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  39.35 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  35.75 
 
 		 256 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  39.09 
 
 		 375 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  38.39 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  35.87 
 
 		 294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  34.77 
 
 		 294 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  36.2 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  34.77 
 
 		 294 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  36.82 
 
 		 310 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  39.9 
 
 		 281 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  36.92 
 
 		 304 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  35.29 
 
 		 289 aa  146  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  35.4 
 
 		 338 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  36.65 
 
 		 297 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  32.41 
 
 		 262 aa  145  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  37.38 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  37.04 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  35.29 
 
 		 305 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  31.97 
 
 		 331 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  37.56 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  34.84 
 
 		 258 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  38.57 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  34.72 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  35.75 
 
 		 328 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  37.02 
 
 		 288 aa  144  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  36.56 
 
 		 334 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  36.53 
 
 		 310 aa  144  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  35.65 
 
 		 305 aa  143  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  38.25 
 
 		 301 aa  143  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  40.53 
 
 		 291 aa  143  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  38.07 
 
 		 314 aa  143  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>