More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3985 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  75.4 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  64 
 
 		 259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  52.89 
 
 		 496 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  52.89 
 
 		 496 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  54.96 
 
 		 535 aa  257  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  51.03 
 
 		 497 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  54.13 
 
 		 532 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  54.36 
 
 		 549 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  51.46 
 
 		 494 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.11 
 
 		 502 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  50.21 
 
 		 497 aa  235  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  49.16 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  45.12 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  45.53 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  45.12 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  44.72 
 
 		 270 aa  231  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  48.12 
 
 		 491 aa  231  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  44.72 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  44.72 
 
 		 270 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  44.31 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  44.72 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  44.72 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  44.72 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  49.59 
 
 		 495 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  48.15 
 
 		 490 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  45.71 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  46.28 
 
 		 486 aa  227  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.96 
 
 		 534 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  45.45 
 
 		 498 aa  221  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.34 
 
 		 501 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  47.44 
 
 		 496 aa  218  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  46.67 
 
 		 578 aa  218  7.999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  45.23 
 
 		 490 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  46.28 
 
 		 493 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  46.67 
 
 		 496 aa  214  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  46.06 
 
 		 497 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  45.87 
 
 		 609 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  46.09 
 
 		 494 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.27 
 
 		 499 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  45.23 
 
 		 497 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  44.13 
 
 		 497 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  45.23 
 
 		 497 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  42.42 
 
 		 474 aa  208  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  44.21 
 
 		 549 aa  208  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  44.67 
 
 		 504 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  45.85 
 
 		 498 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  45.23 
 
 		 544 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  45.15 
 
 		 556 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  46.61 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  47.52 
 
 		 496 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  46.33 
 
 		 498 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  44.81 
 
 		 496 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  42.64 
 
 		 556 aa  205  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  43.51 
 
 		 495 aa  204  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.19 
 
 		 551 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  46.75 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  44.77 
 
 		 492 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  50 
 
 		 494 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.92 
 
 		 497 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  43.94 
 
 		 492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  42.98 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  46.41 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  45.57 
 
 		 521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  46.28 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  41.63 
 
 		 298 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  45.74 
 
 		 300 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  41.63 
 
 		 357 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  38.86 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  41.46 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  39.55 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  39.09 
 
 		 294 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  38.6 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  35.43 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  38.68 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  39.52 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  41.04 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  37.71 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  41.46 
 
 		 331 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2307  hypothetical protein  37.9 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.127828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  36.86 
 
 		 324 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  35.83 
 
 		 288 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  39.65 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  39.38 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  39.57 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  37 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  41.97 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4193  hypothetical protein  38.12 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1170  protein of unknown function DUF344  39.9 
 
 		 278 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0866985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  40.53 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  42.47 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  40.49 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  37.76 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  37.61 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  37.73 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  37.89 
 
 		 309 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  41.94 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3326  hypothetical protein  43.01 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  41.88 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  39.52 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>