More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2786 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  92.92 
 
 		 532 aa  1002    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1078    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  63.42 
 
 		 549 aa  697    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  45.3 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  43.4 
 
 		 494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  41.98 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  41.98 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  42.78 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  41.13 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  42 
 
 		 492 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  40.11 
 
 		 502 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.77 
 
 		 534 aa  392  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  41.81 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  40.41 
 
 		 491 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  40.68 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  38.88 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  40.15 
 
 		 495 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  40.39 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.66 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  39.51 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  38.61 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  38.32 
 
 		 544 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  38.13 
 
 		 496 aa  359  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  39.37 
 
 		 495 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  38.13 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  37.94 
 
 		 497 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.45 
 
 		 497 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  37.76 
 
 		 497 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  38.23 
 
 		 521 aa  352  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  38.22 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.11 
 
 		 504 aa  345  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  37.22 
 
 		 496 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.43 
 
 		 499 aa  342  8e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  35.35 
 
 		 609 aa  342  1e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  35.14 
 
 		 549 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  36.62 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  36.43 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  36.91 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  38.46 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  33.13 
 
 		 492 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  34.62 
 
 		 474 aa  306  9.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  58.05 
 
 		 288 aa  276  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  53.42 
 
 		 578 aa  266  5.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.12 
 
 		 270 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  52.12 
 
 		 270 aa  257  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  54.96 
 
 		 258 aa  257  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  52.12 
 
 		 270 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  54.51 
 
 		 267 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  51.93 
 
 		 270 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  52.12 
 
 		 254 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  52.12 
 
 		 254 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  52.12 
 
 		 270 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  54.08 
 
 		 267 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  52.97 
 
 		 270 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  55.56 
 
 		 264 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  52.59 
 
 		 270 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  53.09 
 
 		 259 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  31.28 
 
 		 556 aa  239  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  31.8 
 
 		 556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  30.27 
 
 		 551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  48.09 
 
 		 279 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  52.17 
 
 		 263 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  49.07 
 
 		 261 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  44.39 
 
 		 305 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  44.14 
 
 		 258 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  42.34 
 
 		 256 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  41.18 
 
 		 320 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  38.78 
 
 		 318 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  41.23 
 
 		 288 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  42.86 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  42.04 
 
 		 301 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  40.54 
 
 		 309 aa  176  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  43.78 
 
 		 364 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  40.54 
 
 		 289 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  38.67 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  40.82 
 
 		 305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  42.66 
 
 		 294 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  41.1 
 
 		 276 aa  174  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  40.95 
 
 		 270 aa  173  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  42.04 
 
 		 304 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  42.4 
 
 		 367 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  42.53 
 
 		 304 aa  173  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  42.53 
 
 		 304 aa  173  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  41.63 
 
 		 280 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  42.06 
 
 		 310 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  40.09 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  41.78 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  41.63 
 
 		 280 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  42.41 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  43.98 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1813  polyphosphate kinase 2 family protein  42.52 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563855  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  41.94 
 
 		 316 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1729  putative transcriptional regulator  42.52 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0830363  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  40.17 
 
 		 338 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1318  putative transcriptional regulator  42.52 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0278  polyphosphate kinase 2  42.52 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0915897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  41.7 
 
 		 324 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1170  protein of unknown function DUF344  38.22 
 
 		 278 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0866985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  40.35 
 
 		 337 aa  171  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>