More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1544 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  68.1 
 
 		 501 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1067    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  59.51 
 
 		 495 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  58.37 
 
 		 492 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  56.97 
 
 		 497 aa  581  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  56.59 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  56.39 
 
 		 544 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  56.45 
 
 		 504 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  56.8 
 
 		 496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  56.19 
 
 		 497 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  56.39 
 
 		 497 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  55.98 
 
 		 497 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  57.26 
 
 		 494 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  55.47 
 
 		 497 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  55.58 
 
 		 498 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  55.58 
 
 		 498 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  51.32 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.62 
 
 		 534 aa  485  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  48.17 
 
 		 490 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  49.39 
 
 		 491 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.41 
 
 		 499 aa  475  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  48.79 
 
 		 493 aa  464  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  47.9 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  47.5 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  40.08 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  40.4 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  38.42 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  38.2 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  40.48 
 
 		 494 aa  369  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  40.29 
 
 		 496 aa  362  8e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  39.75 
 
 		 490 aa  360  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  38.87 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  38.87 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.57 
 
 		 502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  42.76 
 
 		 494 aa  349  7e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  37.2 
 
 		 498 aa  332  9e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  33.7 
 
 		 549 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.47 
 
 		 551 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  34.86 
 
 		 556 aa  299  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  33.63 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  34.21 
 
 		 556 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  34.73 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  52.79 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  48.71 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  48.1 
 
 		 578 aa  227  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  47.01 
 
 		 267 aa  226  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  47.01 
 
 		 267 aa  226  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  46.38 
 
 		 270 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  47.92 
 
 		 609 aa  224  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  46.12 
 
 		 270 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  46.12 
 
 		 270 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  46.12 
 
 		 270 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  46.12 
 
 		 270 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  46.12 
 
 		 254 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  46.12 
 
 		 254 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  46.75 
 
 		 270 aa  220  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  49.23 
 
 		 270 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  44.84 
 
 		 308 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  47.01 
 
 		 259 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  45.57 
 
 		 258 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  47.21 
 
 		 264 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  47.03 
 
 		 261 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  47.21 
 
 		 263 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  41.26 
 
 		 279 aa  174  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  38.18 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  41.15 
 
 		 328 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  39.82 
 
 		 329 aa  167  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  38.86 
 
 		 297 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  38.46 
 
 		 314 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  36.5 
 
 		 338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  37.04 
 
 		 324 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  37.66 
 
 		 305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  38.98 
 
 		 304 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  37.73 
 
 		 393 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  35.16 
 
 		 340 aa  163  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  38.56 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  38.7 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  40.28 
 
 		 310 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  38.64 
 
 		 391 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  36.18 
 
 		 324 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  37.45 
 
 		 304 aa  161  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  39.13 
 
 		 316 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  37.45 
 
 		 304 aa  161  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  37.39 
 
 		 307 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  38.7 
 
 		 316 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  38.18 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  37.83 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  36.65 
 
 		 320 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  37.73 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  39.07 
 
 		 294 aa  160  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  38.25 
 
 		 294 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  34.9 
 
 		 274 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  37.73 
 
 		 383 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  37.56 
 
 		 272 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  37.78 
 
 		 301 aa  160  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1582  hypothetical protein  35.59 
 
 		 257 aa  160  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  37.96 
 
 		 294 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  35.93 
 
 		 295 aa  159  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  38.25 
 
 		 294 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>