More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2856 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  100 
 
 
502 aa  1026    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  46.8 
 
 
490 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  47.48 
 
 
486 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  45.02 
 
 
496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  45.35 
 
 
498 aa  438  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  45.89 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  40.07 
 
 
532 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  42.2 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  40.71 
 
 
497 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  40.11 
 
 
535 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  41.2 
 
 
497 aa  395  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  40.04 
 
 
496 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  40.04 
 
 
496 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  39.23 
 
 
549 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  39.6 
 
 
493 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.29 
 
 
501 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  38.2 
 
 
495 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  41.88 
 
 
496 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  42.08 
 
 
544 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  37.8 
 
 
491 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  39.41 
 
 
496 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  39.87 
 
 
497 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  39.87 
 
 
497 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  37.43 
 
 
494 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.75 
 
 
504 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  39.24 
 
 
497 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  39.24 
 
 
497 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.12 
 
 
534 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  37.2 
 
 
490 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.72 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  39.27 
 
 
498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  34.23 
 
 
549 aa  337  2.9999999999999997e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  39.39 
 
 
498 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  34.42 
 
 
578 aa  334  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  37.82 
 
 
495 aa  332  9e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  37.85 
 
 
492 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  37.57 
 
 
521 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  39.05 
 
 
474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.78 
 
 
499 aa  320  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  36.47 
 
 
492 aa  317  4e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  36.32 
 
 
496 aa  289  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  53.39 
 
 
267 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  53.39 
 
 
267 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  49.79 
 
 
609 aa  257  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.63 
 
 
270 aa  256  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  50.63 
 
 
254 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.63 
 
 
270 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  50.63 
 
 
254 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  50.63 
 
 
270 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  50.42 
 
 
270 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  50.42 
 
 
270 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  51.71 
 
 
270 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  49.58 
 
 
288 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  51.08 
 
 
270 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  47.11 
 
 
258 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  46.96 
 
 
308 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  31 
 
 
556 aa  232  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  31.06 
 
 
556 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  46.09 
 
 
259 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  29.84 
 
 
551 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  45.42 
 
 
264 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  43.78 
 
 
263 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  42.37 
 
 
279 aa  203  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  43.58 
 
 
261 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  40.91 
 
 
263 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  39.44 
 
 
328 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  41.07 
 
 
324 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  41.2 
 
 
375 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  41.44 
 
 
310 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  40.6 
 
 
288 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  41.48 
 
 
318 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  35.45 
 
 
300 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  41.52 
 
 
309 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  37.35 
 
 
301 aa  186  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  39.81 
 
 
367 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  39.64 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  39.37 
 
 
262 aa  184  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  39.91 
 
 
359 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  39.19 
 
 
298 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  40.35 
 
 
304 aa  183  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  40 
 
 
310 aa  183  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  39.46 
 
 
337 aa  183  8.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  41.63 
 
 
302 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  38.2 
 
 
318 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  39.82 
 
 
320 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  40.09 
 
 
314 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  41.51 
 
 
405 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  38.12 
 
 
340 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  37.07 
 
 
338 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  41.55 
 
 
327 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  36.78 
 
 
329 aa  180  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  35.23 
 
 
297 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  40.54 
 
 
258 aa  179  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  42.03 
 
 
307 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  39.64 
 
 
256 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  40 
 
 
365 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  38.36 
 
 
305 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5508  hypothetical protein  38.12 
 
 
283 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.980211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  35.32 
 
 
331 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  40.37 
 
 
304 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>