More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1989 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 490 aa  1008    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  52.98 
 
 		 494 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  51.12 
 
 		 496 aa  519  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.8 
 
 		 502 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  47.58 
 
 		 498 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  44.74 
 
 		 486 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  43.61 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  43.2 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  43.2 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  41.56 
 
 		 532 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  42.31 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  41.13 
 
 		 535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  41.45 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  41.3 
 
 		 492 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  40.98 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  40.78 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.88 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  41.7 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  40.57 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  40.45 
 
 		 497 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.51 
 
 		 534 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  39.85 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  39.3 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  39.76 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  38.09 
 
 		 491 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  39.92 
 
 		 496 aa  362  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  40.08 
 
 		 544 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.96 
 
 		 504 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  39.88 
 
 		 496 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  39.52 
 
 		 495 aa  355  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.93 
 
 		 499 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.98 
 
 		 497 aa  346  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  39.26 
 
 		 498 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  39.75 
 
 		 521 aa  339  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  38.84 
 
 		 498 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  39.11 
 
 		 474 aa  336  7e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  34.55 
 
 		 578 aa  334  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  36.79 
 
 		 494 aa  333  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  33.94 
 
 		 549 aa  332  7.000000000000001e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  36.68 
 
 		 492 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  35.52 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  33.2 
 
 		 556 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  51.95 
 
 		 288 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  33.54 
 
 		 551 aa  252  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  51.48 
 
 		 609 aa  251  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.63 
 
 		 270 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.63 
 
 		 270 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  50.63 
 
 		 270 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  50.63 
 
 		 254 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  50.63 
 
 		 254 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  50.63 
 
 		 270 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  50.43 
 
 		 270 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.08 
 
 		 267 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  50.43 
 
 		 270 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  31.18 
 
 		 556 aa  236  8e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.65 
 
 		 267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  54.5 
 
 		 270 aa  229  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  47.5 
 
 		 259 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  45.9 
 
 		 264 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  45.23 
 
 		 258 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  45.22 
 
 		 308 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  45 
 
 		 261 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  42.99 
 
 		 263 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  49.22 
 
 		 263 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  44.09 
 
 		 276 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0147  polyphosphate kinase 2  43.64 
 
 		 269 aa  196  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.612041  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  43.06 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  39.85 
 
 		 320 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  44.29 
 
 		 279 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  37.41 
 
 		 310 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  40.51 
 
 		 338 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  43.78 
 
 		 293 aa  190  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  38.37 
 
 		 375 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  41.18 
 
 		 262 aa  190  5e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  41.2 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  41.94 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  45.45 
 
 		 310 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  36.78 
 
 		 305 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  41.82 
 
 		 369 aa  186  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  41.28 
 
 		 304 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  45.99 
 
 		 367 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4471  hypothetical protein  40.17 
 
 		 272 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  42.4 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  39.81 
 
 		 284 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  40.47 
 
 		 308 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  39.91 
 
 		 324 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  41.4 
 
 		 288 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  42.08 
 
 		 303 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  39.04 
 
 		 292 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  39.11 
 
 		 318 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  39.73 
 
 		 314 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  40.26 
 
 		 324 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  41.18 
 
 		 328 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  41.33 
 
 		 324 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  41.82 
 
 		 280 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  41.82 
 
 		 280 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  40.65 
 
 		 305 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  38.02 
 
 		 310 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>