More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3585 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  62.27 
 
 		 492 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  100 
 
 		 501 aa  1026    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  68.1 
 
 		 521 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  61.66 
 
 		 495 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  58.3 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  58.91 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  58.7 
 
 		 544 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  57.98 
 
 		 497 aa  593  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  56.77 
 
 		 504 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  56.11 
 
 		 497 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  56.11 
 
 		 497 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  55.91 
 
 		 497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  57.09 
 
 		 494 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  55.91 
 
 		 497 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  54.51 
 
 		 498 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  53.71 
 
 		 498 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  52.21 
 
 		 497 aa  521  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.91 
 
 		 534 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  50.51 
 
 		 499 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  49.69 
 
 		 490 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  50.1 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  48.89 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  49.1 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  48.49 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  42.66 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  41.32 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  42.94 
 
 		 486 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  41.97 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  41.97 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  39.88 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  39.47 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  39.66 
 
 		 535 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.29 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  40.04 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  39.92 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  38.63 
 
 		 496 aa  365  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  39.56 
 
 		 498 aa  349  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  36.69 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  35.47 
 
 		 556 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  35.16 
 
 		 549 aa  309  6.999999999999999e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  35.73 
 
 		 556 aa  302  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.08 
 
 		 551 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  34.73 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  50 
 
 		 270 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  52.16 
 
 		 288 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.44 
 
 		 267 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  50.63 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.44 
 
 		 267 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.63 
 
 		 270 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  50.63 
 
 		 270 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  50.63 
 
 		 254 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.63 
 
 		 270 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  50.63 
 
 		 254 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  52.12 
 
 		 270 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  47.93 
 
 		 578 aa  236  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  51.58 
 
 		 609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  54.73 
 
 		 270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  46.96 
 
 		 259 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  46.34 
 
 		 258 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  46.15 
 
 		 264 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  48.42 
 
 		 263 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  44.03 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  43.17 
 
 		 279 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  39.83 
 
 		 307 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  39.21 
 
 		 365 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  38.24 
 
 		 262 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  36.64 
 
 		 263 aa  172  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  38.94 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  39.13 
 
 		 375 aa  170  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  36.33 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  39.01 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  38.96 
 
 		 265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  37.5 
 
 		 292 aa  167  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  41.01 
 
 		 285 aa  167  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  35.76 
 
 		 383 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  39.21 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  38.05 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  37.61 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  38.01 
 
 		 318 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  38.74 
 
 		 324 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  37.39 
 
 		 369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  37.55 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  38.6 
 
 		 303 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  38.16 
 
 		 329 aa  166  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  38.22 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  38.22 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  38.43 
 
 		 391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  38.67 
 
 		 272 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  38.26 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  38.26 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  37.12 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  36.84 
 
 		 294 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  37 
 
 		 314 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  37.5 
 
 		 288 aa  164  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  36.12 
 
 		 326 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  40.44 
 
 		 304 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  36.56 
 
 		 297 aa  163  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  39.29 
 
 		 256 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  36.65 
 
 		 276 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>