More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1640 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  80.08 
 
 		 497 aa  835    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1021    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  94.58 
 
 		 498 aa  950    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  80.08 
 
 		 497 aa  836    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  80.08 
 
 		 497 aa  834    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  80.12 
 
 		 504 aa  838    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  79.68 
 
 		 497 aa  833    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  71.77 
 
 		 544 aa  750    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  72.38 
 
 		 496 aa  754    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  76.42 
 
 		 494 aa  775    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  79.23 
 
 		 496 aa  816    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  56.65 
 
 		 492 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  56.68 
 
 		 495 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  53.71 
 
 		 501 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  54.69 
 
 		 497 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  55.58 
 
 		 521 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.74 
 
 		 534 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  48.59 
 
 		 493 aa  478  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  48.19 
 
 		 497 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  47.36 
 
 		 491 aa  458  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.44 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  46.45 
 
 		 495 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  46.99 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  44.24 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  43.95 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  42.05 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  42.05 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  42.8 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  40.04 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  38.32 
 
 		 549 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  38.84 
 
 		 490 aa  350  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  38.83 
 
 		 496 aa  349  8e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  36.62 
 
 		 535 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.83 
 
 		 502 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  36.64 
 
 		 532 aa  346  6e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  37.06 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  35.62 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  36.77 
 
 		 498 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  37.81 
 
 		 556 aa  322  9.000000000000001e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.86 
 
 		 551 aa  317  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  36.38 
 
 		 556 aa  316  6e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  33.33 
 
 		 578 aa  307  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  35.06 
 
 		 492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  33.41 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  52.38 
 
 		 288 aa  249  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  50.21 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  49.79 
 
 		 259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.42 
 
 		 267 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  49.13 
 
 		 308 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50 
 
 		 267 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  47.28 
 
 		 270 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  48.51 
 
 		 270 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  46.25 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  47.23 
 
 		 254 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  47.23 
 
 		 270 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  47.23 
 
 		 270 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  47.23 
 
 		 270 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  47.23 
 
 		 254 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  47.23 
 
 		 270 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  52.31 
 
 		 270 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  50.24 
 
 		 264 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  47.25 
 
 		 261 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  50.52 
 
 		 263 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  43.16 
 
 		 279 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  38.02 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  37.86 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  40.25 
 
 		 289 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  37.67 
 
 		 262 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  38.81 
 
 		 304 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  36.78 
 
 		 294 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3243  protein of unknown function DUF344  34.69 
 
 		 300 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3677  hypothetical protein  39.09 
 
 		 274 aa  163  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  39.25 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  37.17 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  38.79 
 
 		 310 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  34.31 
 
 		 316 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  40.32 
 
 		 263 aa  161  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  37.93 
 
 		 337 aa  161  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  34.29 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  37.93 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  38.32 
 
 		 307 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  41.4 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  43.01 
 
 		 299 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  39.19 
 
 		 308 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  38.79 
 
 		 304 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  38.18 
 
 		 294 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  37.9 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  36.09 
 
 		 305 aa  160  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  39.47 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  37.73 
 
 		 294 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  38.91 
 
 		 300 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  37.39 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  39.36 
 
 		 310 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  39.68 
 
 		 308 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  35.17 
 
 		 316 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  35.17 
 
 		 316 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  36.94 
 
 		 320 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  39.89 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>