More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4097 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  83.7 
 
 		 497 aa  873    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  80.12 
 
 		 498 aa  818    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  80.12 
 
 		 498 aa  813    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  79.47 
 
 		 494 aa  804    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  100 
 
 		 504 aa  1034    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  82.73 
 
 		 496 aa  847    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  76.72 
 
 		 496 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  76.72 
 
 		 544 aa  790    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  82.49 
 
 		 497 aa  864    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  83.7 
 
 		 497 aa  874    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  83.1 
 
 		 497 aa  867    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  58.16 
 
 		 492 aa  591  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  56.77 
 
 		 501 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  58.91 
 
 		 495 aa  586  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  57.32 
 
 		 497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  56.45 
 
 		 521 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.12 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  49.2 
 
 		 493 aa  478  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  49.09 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.22 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  47.15 
 
 		 491 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  45.4 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  46.68 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  46.48 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  41.68 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  42.2 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  40.86 
 
 		 486 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  39.31 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  39.31 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  39.96 
 
 		 490 aa  361  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  37.59 
 
 		 549 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  39 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.75 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  38.11 
 
 		 535 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  36.95 
 
 		 532 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  37.16 
 
 		 494 aa  334  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  35.1 
 
 		 549 aa  324  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  37.02 
 
 		 556 aa  316  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  33.55 
 
 		 492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  35.5 
 
 		 498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.01 
 
 		 551 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  36.75 
 
 		 556 aa  310  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  33.8 
 
 		 578 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  34.92 
 
 		 474 aa  282  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  53.95 
 
 		 288 aa  253  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  51.49 
 
 		 609 aa  250  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.28 
 
 		 267 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  49.79 
 
 		 270 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.85 
 
 		 267 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  49.57 
 
 		 270 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  48.93 
 
 		 270 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  48.5 
 
 		 254 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.5 
 
 		 270 aa  229  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  48.5 
 
 		 254 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.5 
 
 		 270 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  48.5 
 
 		 270 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  47.56 
 
 		 259 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  47.01 
 
 		 270 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  44.67 
 
 		 258 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  46.67 
 
 		 264 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  47.47 
 
 		 261 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  42.8 
 
 		 279 aa  199  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  45.66 
 
 		 263 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  42.86 
 
 		 307 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  38.39 
 
 		 262 aa  182  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  41.41 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  37.4 
 
 		 289 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  40.76 
 
 		 299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  38.46 
 
 		 294 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  41.28 
 
 		 303 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  38.7 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  38.46 
 
 		 294 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  37.22 
 
 		 263 aa  170  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  34.21 
 
 		 298 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  32.82 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  35.46 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  34.21 
 
 		 357 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  34.66 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  38.16 
 
 		 365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  38.91 
 
 		 328 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  38.16 
 
 		 294 aa  166  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  34.27 
 
 		 326 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  38.05 
 
 		 305 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  39.35 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  39.07 
 
 		 337 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  39.91 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  37.84 
 
 		 256 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  36.96 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  39.45 
 
 		 318 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  37.39 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  36.96 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2058  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  37.61 
 
 		 269 aa  164  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000117071  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  38.18 
 
 		 294 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1834  hypothetical protein  39.45 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  42.02 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  37.84 
 
 		 258 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  39.11 
 
 		 310 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  40.18 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>