More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0787 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1150    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  56.54 
 
 
556 aa  627  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  56.89 
 
 
551 aa  615  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  38.67 
 
 
497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  38.4 
 
 
497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  38.1 
 
 
497 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  37.52 
 
 
496 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  37.52 
 
 
497 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  37.57 
 
 
544 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.02 
 
 
504 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  36.1 
 
 
498 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  36.64 
 
 
496 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.47 
 
 
501 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  37.18 
 
 
494 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  37.22 
 
 
498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  35.5 
 
 
492 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  34.61 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  35.48 
 
 
495 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  33.4 
 
 
497 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  32.85 
 
 
497 aa  276  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  35.11 
 
 
491 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  33.4 
 
 
493 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  34.21 
 
 
521 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  31.28 
 
 
474 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  32.97 
 
 
496 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  32.97 
 
 
496 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  34.01 
 
 
495 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  31.92 
 
 
499 aa  264  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  34.27 
 
 
494 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  33.21 
 
 
496 aa  251  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  32.14 
 
 
490 aa  249  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  32.58 
 
 
486 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  31.28 
 
 
535 aa  239  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  31.27 
 
 
492 aa  236  8e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  31.18 
 
 
490 aa  236  9e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  31.87 
 
 
532 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  30.42 
 
 
498 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  28.67 
 
 
549 aa  233  8.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  31.06 
 
 
502 aa  231  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  31.75 
 
 
534 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  28.35 
 
 
496 aa  227  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  54.5 
 
 
549 aa  220  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  46.09 
 
 
288 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  51.04 
 
 
609 aa  213  7e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  29.67 
 
 
494 aa  212  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  50.25 
 
 
264 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  45.45 
 
 
270 aa  207  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  44.4 
 
 
270 aa  207  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  45.87 
 
 
270 aa  207  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  45.04 
 
 
270 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  40.14 
 
 
308 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  45.04 
 
 
270 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  44 
 
 
254 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  45.04 
 
 
270 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  44 
 
 
254 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  45.45 
 
 
267 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  42.64 
 
 
258 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  43.19 
 
 
578 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  45.04 
 
 
267 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  42.8 
 
 
259 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  48.5 
 
 
270 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  41.98 
 
 
261 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  47.03 
 
 
263 aa  188  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  36.03 
 
 
279 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  36.89 
 
 
306 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  36.78 
 
 
322 aa  153  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  36.33 
 
 
302 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  38.24 
 
 
256 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  39.71 
 
 
305 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4100  protein of unknown function DUF344  38.27 
 
 
280 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  35.5 
 
 
290 aa  151  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  37.6 
 
 
310 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  37.76 
 
 
280 aa  150  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  37.76 
 
 
280 aa  150  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  39.2 
 
 
324 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  39.2 
 
 
324 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  41.38 
 
 
304 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  36.63 
 
 
320 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  33.6 
 
 
271 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  38.69 
 
 
305 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  39.9 
 
 
304 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  36.95 
 
 
359 aa  148  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1583  hypothetical protein  38.19 
 
 
301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  36.95 
 
 
337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  39.51 
 
 
316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  36.76 
 
 
258 aa  147  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  38.35 
 
 
310 aa  147  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  37.62 
 
 
270 aa  146  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  35.89 
 
 
310 aa  146  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  38.12 
 
 
308 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  38.12 
 
 
304 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  34.57 
 
 
357 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0614  hypothetical protein  37.8 
 
 
307 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  38.24 
 
 
338 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  34.43 
 
 
305 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  38.05 
 
 
296 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  39.6 
 
 
305 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  34.15 
 
 
277 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  36.59 
 
 
316 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  33.71 
 
 
290 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>