More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1873 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1003    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  56.14 
 
 
495 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  56.14 
 
 
493 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  52.21 
 
 
501 aa  521  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  51.91 
 
 
495 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  52.41 
 
 
492 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  51.01 
 
 
497 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  49.9 
 
 
490 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  51.42 
 
 
496 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  51.21 
 
 
544 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  50.3 
 
 
496 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  48.69 
 
 
497 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  49.2 
 
 
497 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  49.4 
 
 
497 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  49.2 
 
 
497 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.09 
 
 
504 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  51.32 
 
 
521 aa  471  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  49.9 
 
 
494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.52 
 
 
534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  47.27 
 
 
491 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  48.19 
 
 
498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  47.98 
 
 
498 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  45.16 
 
 
494 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  43.95 
 
 
497 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  44.6 
 
 
499 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  46.41 
 
 
496 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  44.24 
 
 
486 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  41.73 
 
 
496 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  41.73 
 
 
496 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.2 
 
 
502 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  40.91 
 
 
532 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  41.7 
 
 
490 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  40.68 
 
 
535 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  40.3 
 
 
549 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  39.92 
 
 
496 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  39.88 
 
 
498 aa  369  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  39.52 
 
 
494 aa  364  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  38.7 
 
 
549 aa  359  8e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  39.08 
 
 
578 aa  351  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  36.07 
 
 
492 aa  328  9e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  35.6 
 
 
474 aa  300  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  32.85 
 
 
556 aa  276  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  33.02 
 
 
556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  32.95 
 
 
551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  53.25 
 
 
609 aa  261  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  53.62 
 
 
288 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.57 
 
 
267 aa  239  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.73 
 
 
270 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.73 
 
 
270 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  48.73 
 
 
270 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  48.73 
 
 
270 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  49.34 
 
 
270 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  48.73 
 
 
254 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  48.73 
 
 
254 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.57 
 
 
267 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  48.1 
 
 
270 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  50.21 
 
 
258 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  51.65 
 
 
264 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  48.46 
 
 
270 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  47.6 
 
 
308 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  48.71 
 
 
259 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  49.77 
 
 
261 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  52.02 
 
 
263 aa  210  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  42.11 
 
 
279 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  42.79 
 
 
285 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  37.67 
 
 
292 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  38.49 
 
 
365 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  38.91 
 
 
405 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  40.09 
 
 
304 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  40.36 
 
 
304 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  40.38 
 
 
258 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  38.08 
 
 
383 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  38.77 
 
 
294 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  38.5 
 
 
284 aa  168  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  39.37 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  38.18 
 
 
320 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  40.45 
 
 
375 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  38.86 
 
 
294 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  38.86 
 
 
294 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  39.37 
 
 
256 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  41.63 
 
 
294 aa  166  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  38.2 
 
 
289 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4264  hypothetical protein  39.72 
 
 
310 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  36.82 
 
 
324 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  35.81 
 
 
280 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  38.77 
 
 
280 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  35.81 
 
 
280 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  36.4 
 
 
324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  40.1 
 
 
281 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  34.89 
 
 
272 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  37.02 
 
 
338 aa  163  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  35.51 
 
 
309 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  38.7 
 
 
391 aa  162  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  36.04 
 
 
271 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  36.49 
 
 
263 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  38.46 
 
 
337 aa  162  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  37.73 
 
 
310 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  36.28 
 
 
276 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  36.95 
 
 
367 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  37.89 
 
 
304 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>